Protein–RNA interactions for Protein: Q12146

PSF3, DNA replication complex GINS protein PSF3, yeastyeast

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PSF3Q12146 YMR045CYMR045C 5268 nt1.99□□□□□ -2.09
PSF3Q12146 AGC1YPR021C 2709 nt1.99□□□□□ -2.09
PSF3Q12146 TDA9YML081W 3756 nt1.99□□□□□ -2.09
PSF3Q12146 SEY1YOR165W 2331 nt1.99□□□□□ -2.09
PSF3Q12146 PIP2YOR363C 2991 nt1.98□□□□□ -2.09
PSF3Q12146 ENV11YGR071C 2583 nt1.98□□□□□ -2.09
PSF3Q12146 MLH3YPL164C 2148 nt1.98□□□□□ -2.09
PSF3Q12146 HMI1YOL095C 2121 nt1.97□□□□□ -2.09
PSF3Q12146 YDR344CYDR344C 444 nt1.97□□□□□ -2.09
PSF3Q12146 YIL032CYIL032C 357 nt1.97□□□□□ -2.09
PSF3Q12146 YOL160WYOL160W 342 nt1.97□□□□□ -2.09
PSF3Q12146 YOR282WYOR282W 321 nt1.97□□□□□ -2.09
PSF3Q12146 NIP100YPL174C 2607 nt1.96□□□□□ -2.1
PSF3Q12146 ALG13YGL047W 609 nt1.96□□□□□ -2.1
PSF3Q12146 COA6YMR244C-A 315 nt1.96□□□□□ -2.1
PSF3Q12146 UBR2YLR024C 5619 nt1.96□□□□□ -2.1
PSF3Q12146 MGA2YIR033W 3342 nt1.96□□□□□ -2.1
PSF3Q12146 FRK1YPL141C 2598 nt1.95□□□□□ -2.1
PSF3Q12146 HSL1YKL101W 4557 nt1.95□□□□□ -2.1
PSF3Q12146 RTP1YMR185W 2946 nt1.94□□□□□ -2.1
PSF3Q12146 MDM20YOL076W 2391 nt1.94□□□□□ -2.1
PSF3Q12146 OST1YJL002C 1431 nt1.94□□□□□ -2.1
PSF3Q12146 SDH2YLL041C 801 nt1.94□□□□□ -2.1
PSF3Q12146 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt1.94□□□□□ -2.1
PSF3Q12146 SAS3YBL052C 2496 nt1.93□□□□□ -2.1
PSF3Q12146 YJR039WYJR039W 3366 nt1.93□□□□□ -2.1
PSF3Q12146 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt1.93□□□□□ -2.1
PSF3Q12146 APL2YKL135C 2181 nt1.93□□□□□ -2.1
PSF3Q12146 DGR2YKL121W 2559 nt1.93□□□□□ -2.1
PSF3Q12146 GCN2YDR283C 4980 nt1.92□□□□□ -2.1
PSF3Q12146 COG8YML071C 1824 nt1.92□□□□□ -2.1
PSF3Q12146 YGR069WYGR069W 336 nt1.92□□□□□ -2.1
PSF3Q12146 YHL042WYHL042W 453 nt1.92□□□□□ -2.1
PSF3Q12146 YHR210CYHR210C 1026 nt1.92□□□□□ -2.1
PSF3Q12146 ZIP2YGL249W 2115 nt1.91□□□□□ -2.1
PSF3Q12146 HMRA2YCR096C 360 nt1.91□□□□□ -2.1
PSF3Q12146 MSH6YDR097C 3729 nt1.91□□□□□ -2.1
PSF3Q12146 PIG1YLR273C 1947 nt1.91□□□□□ -2.1
PSF3Q12146 snR60snR60 104 nt1.9□□□□□ -2.11
PSF3Q12146 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt1.9□□□□□ -2.11
PSF3Q12146 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt1.9□□□□□ -2.11
PSF3Q12146 TBS1YBR150C 3285 nt1.9□□□□□ -2.11
PSF3Q12146 SPC98YNL126W 2541 nt1.9□□□□□ -2.11
PSF3Q12146 LCD1YDR499W 2244 nt1.89□□□□□ -2.11
PSF3Q12146 YNL144CYNL144C 2223 nt1.89□□□□□ -2.11
PSF3Q12146 SSS1YDR086C 243 nt1.89□□□□□ -2.11
PSF3Q12146 YDR366CYDR366C 399 nt1.89□□□□□ -2.11
PSF3Q12146 CDC31YOR257W 486 nt1.89□□□□□ -2.11
PSF3Q12146 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt1.89□□□□□ -2.11
PSF3Q12146 MPT5YGL178W 2580 nt1.89□□□□□ -2.11
PSF3Q12146 SCW11YGL028C 1629 nt1.88□□□□□ -2.11
PSF3Q12146 PMD1YER132C 5262 nt1.88□□□□□ -2.11
PSF3Q12146 RAD61YDR014W 1944 nt1.88□□□□□ -2.11
PSF3Q12146 YDL211CYDL211C 1119 nt1.88□□□□□ -2.11
PSF3Q12146 PAU2YEL049W 363 nt1.87□□□□□ -2.11
PSF3Q12146 TMA7YLR262C-A 195 nt1.87□□□□□ -2.11
PSF3Q12146 RAD34YDR314C 2079 nt1.87□□□□□ -2.11
PSF3Q12146 SPT21YMR179W 2277 nt1.87□□□□□ -2.11
PSF3Q12146 UTP21YLR409C 2820 nt1.86□□□□□ -2.11
PSF3Q12146 CCH1YGR217W 6120 nt1.86□□□□□ -2.11
PSF3Q12146 MAD1YGL086W 2250 nt1.86□□□□□ -2.11
PSF3Q12146 PAU3YCR104W 375 nt1.86□□□□□ -2.11
PSF3Q12146 snR8snR8 190 nt1.86□□□□□ -2.11
PSF3Q12146 YJL015CYJL015C 285 nt1.86□□□□□ -2.11
PSF3Q12146 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt1.86□□□□□ -2.11
PSF3Q12146 BPH1YCR032W 6504 nt1.86□□□□□ -2.11
PSF3Q12146 LHS1YKL073W 2646 nt1.86□□□□□ -2.11
PSF3Q12146 YCK3YER123W 1575 nt1.85□□□□□ -2.11
PSF3Q12146 YLR422WYLR422W 5799 nt1.85□□□□□ -2.11
PSF3Q12146 YLR419WYLR419W 4308 nt1.85□□□□□ -2.11
PSF3Q12146 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt1.85□□□□□ -2.11
PSF3Q12146 INA22YIR024C 651 nt1.85□□□□□ -2.11
PSF3Q12146 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt1.85□□□□□ -2.11
PSF3Q12146 IRA1YBR140C 9279 nt1.85□□□□□ -2.11
PSF3Q12146 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.84□□□□□ -2.11
PSF3Q12146 LAA1YJL207C 6045 nt1.84□□□□□ -2.12
PSF3Q12146 LRE1YCL051W 1752 nt1.84□□□□□ -2.12
PSF3Q12146 SKI3YPR189W 4299 nt1.83□□□□□ -2.12
PSF3Q12146 VIK1YPL253C 1944 nt1.82□□□□□ -2.12
PSF3Q12146 YNL028WYNL028W 318 nt1.82□□□□□ -2.12
PSF3Q12146 NOC3YLR002C 1992 nt1.81□□□□□ -2.12
PSF3Q12146 RPL34BYIL052C 366 nt1.81□□□□□ -2.12
PSF3Q12146 CSE2YNR010W 450 nt1.81□□□□□ -2.12
PSF3Q12146 SPO75YLL005C 2607 nt1.81□□□□□ -2.12
PSF3Q12146 MON2YNL297C 4911 nt1.8□□□□□ -2.12
PSF3Q12146 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.8□□□□□ -2.12
PSF3Q12146 KCS1YDR017C 3153 nt1.8□□□□□ -2.12
PSF3Q12146 RPL31AYDL075W 342 nt1.79□□□□□ -2.12
PSF3Q12146 EMC5YIL027C 426 nt1.79□□□□□ -2.12
PSF3Q12146 PFD1YJL179W 330 nt1.79□□□□□ -2.12
PSF3Q12146 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt1.79□□□□□ -2.12
PSF3Q12146 YGR130CYGR130C 2451 nt1.79□□□□□ -2.12
PSF3Q12146 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.78□□□□□ -2.12
PSF3Q12146 SPO24YPR036W-A 204 nt1.78□□□□□ -2.12
PSF3Q12146 STF2YGR008C 255 nt1.77□□□□□ -2.13
PSF3Q12146 YIR044CYIR044C 186 nt1.77□□□□□ -2.13
PSF3Q12146 NUT1YGL151W 3399 nt1.77□□□□□ -2.13
PSF3Q12146 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt1.76□□□□□ -2.13
PSF3Q12146 YJL022WYJL022W 309 nt1.76□□□□□ -2.13
PSF3Q12146 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt1.76□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.2 ms