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Protein–RNA interactions for Protein: Q08873
SCP1, Transgelin, yeast
Predictions only
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200 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
SCP1
Q08873
NPC2
YDL046W
522 nt
-0.62
□□□□□ -2.51
SCP1
Q08873
YMR158C-A
YMR158C-A
138 nt
-0.62
□□□□□ -2.51
SCP1
Q08873
RUF20
RUF20
443 nt
-0.62
□□□□□ -2.51
SCP1
Q08873
LEE1
YPL054W
906 nt
-0.62
□□□□□ -2.51
SCP1
Q08873
UTP8
YGR128C
2142 nt
-0.62
□□□□□ -2.51
SCP1
Q08873
OST4
YDL232W
111 nt
-0.65
□□□□□ -2.51
SCP1
Q08873
YEL010W
YEL010W
351 nt
-0.65
□□□□□ -2.51
SCP1
Q08873
LSM4
YER112W
564 nt
-0.65
□□□□□ -2.51
SCP1
Q08873
RPS26A
YGL189C
360 nt
-0.65
□□□□□ -2.51
SCP1
Q08873
MYO1
YHR023W
5787 nt
-0.66
□□□□□ -2.51
SCP1
Q08873
MMS21
YEL019C
804 nt
-0.66
□□□□□ -2.52
SCP1
Q08873
YMR153C-A
YMR153C-A
336 nt
-0.66
□□□□□ -2.52
SCP1
Q08873
RPS10B
YMR230W
318 nt
-0.66
□□□□□ -2.52
SCP1
Q08873
YLL032C
YLL032C
2478 nt
-0.66
□□□□□ -2.52
SCP1
Q08873
THG1
YGR024C
714 nt
-0.67
□□□□□ -2.52
SCP1
Q08873
YJL086C
YJL086C
369 nt
-0.67
□□□□□ -2.52
SCP1
Q08873
snR128
snR128
126 nt
-0.67
□□□□□ -2.52
SCP1
Q08873
ATP20
YPR020W
348 nt
-0.68
□□□□□ -2.52
SCP1
Q08873
NFU1
YKL040C
771 nt
-0.69
□□□□□ -2.52
SCP1
Q08873
AFB1
YLR040C
675 nt
-0.69
□□□□□ -2.52
SCP1
Q08873
YNL146W
YNL146W
303 nt
-0.69
□□□□□ -2.52
SCP1
Q08873
snR79
snR79
84 nt
-0.7
□□□□□ -2.52
SCP1
Q08873
YDR008C
YDR008C
351 nt
-0.7
□□□□□ -2.52
SCP1
Q08873
MAM33
YIL070C
801 nt
-0.7
□□□□□ -2.52
SCP1
Q08873
COX5B
YIL111W
456 nt
-0.7
□□□□□ -2.52
SCP1
Q08873
PRP21
YJL203W
843 nt
-0.7
□□□□□ -2.52
SCP1
Q08873
GIM5
YML094W
492 nt
-0.7
□□□□□ -2.52
SCP1
Q08873
YNL211C
YNL211C
261 nt
-0.7
□□□□□ -2.52
SCP1
Q08873
TFB6
YOR352W
1032 nt
-0.71
□□□□□ -2.52
SCP1
Q08873
SVS1
YPL163C
783 nt
-0.71
□□□□□ -2.52
SCP1
Q08873
PAN3
YKL025C
2040 nt
-0.71
□□□□□ -2.52
SCP1
Q08873
YKU70
YMR284W
1809 nt
-0.72
□□□□□ -2.52
SCP1
Q08873
MRPL31
YKL138C
396 nt
-0.72
□□□□□ -2.52
SCP1
Q08873
ECM9
YKR004C
1134 nt
-0.72
□□□□□ -2.52
SCP1
Q08873
YNL171C
YNL171C
369 nt
-0.72
□□□□□ -2.52
SCP1
Q08873
COY1
YKL179C
2040 nt
-0.72
□□□□□ -2.53
SCP1
Q08873
OLI1
Q0130
231 nt
-0.73
□□□□□ -2.53
SCP1
Q08873
POP6
YGR030C
477 nt
-0.73
□□□□□ -2.53
SCP1
Q08873
YPR160W-A
YPR160W-A
81 nt
-0.73
□□□□□ -2.53
SCP1
Q08873
snR57
snR57
88 nt
-0.74
□□□□□ -2.53
SCP1
Q08873
YCR024C-B
YCR024C-B
267 nt
-0.74
□□□□□ -2.53
SCP1
Q08873
YJR079W
YJR079W
330 nt
-0.74
□□□□□ -2.53
SCP1
Q08873
CMS1
YLR003C
876 nt
-0.74
□□□□□ -2.53
SCP1
Q08873
YPR099C
YPR099C
357 nt
-0.74
□□□□□ -2.53
SCP1
Q08873
VPS63
YLR261C
327 nt
-0.75
□□□□□ -2.53
SCP1
Q08873
GLG1
YKR058W
1851 nt
-0.75
□□□□□ -2.53
SCP1
Q08873
NIP100
YPL174C
2607 nt
-0.76
□□□□□ -2.53
SCP1
Q08873
HAL9
YOL089C
3093 nt
-0.76
□□□□□ -2.53
SCP1
Q08873
QCR7
YDR529C
384 nt
-0.76
□□□□□ -2.53
SCP1
Q08873
BI4
Q0120
1917 nt
-0.76
□□□□□ -2.53
SCP1
Q08873
MCM10
YIL150C
1716 nt
-0.77
□□□□□ -2.53
SCP1
Q08873
YCR022C
YCR022C
345 nt
-0.77
□□□□□ -2.53
SCP1
Q08873
TDA2
YER071C
381 nt
-0.77
□□□□□ -2.53
SCP1
Q08873
YER076W-A
YER076W-A
348 nt
-0.77
□□□□□ -2.53
SCP1
Q08873
YJL007C
YJL007C
315 nt
-0.77
□□□□□ -2.53
SCP1
Q08873
YMR141W-A
YMR141W-A
225 nt
-0.77
□□□□□ -2.53
SCP1
Q08873
COX7
YMR256C
183 nt
-0.77
□□□□□ -2.53
SCP1
Q08873
YPL119C-A
YPL119C-A
264 nt
-0.77
□□□□□ -2.53
SCP1
Q08873
YER038W-A
YER038W-A
381 nt
-0.78
□□□□□ -2.53
SCP1
Q08873
YAL067W-A
YAL067W-A
228 nt
-0.78
□□□□□ -2.53
SCP1
Q08873
YPL185W
YPL185W
396 nt
-0.78
□□□□□ -2.53
SCP1
Q08873
NNF2
YGR089W
2811 nt
-0.79
□□□□□ -2.54
SCP1
Q08873
YLR146W-A
YLR146W-A
189 nt
-0.79
□□□□□ -2.54
SCP1
Q08873
HTB2
YBL002W
396 nt
-0.79
□□□□□ -2.54
SCP1
Q08873
ZIP2
YGL249W
2115 nt
-0.8
□□□□□ -2.54
SCP1
Q08873
RFX1
YLR176C
2436 nt
-0.8
□□□□□ -2.54
SCP1
Q08873
RPM2
YML091C
3609 nt
-0.81
□□□□□ -2.54
SCP1
Q08873
ASE1
YOR058C
2658 nt
-0.81
□□□□□ -2.54
SCP1
Q08873
PTP2
YOR208W
2253 nt
-0.81
□□□□□ -2.54
SCP1
Q08873
YER158W-A
YER158W-A
216 nt
-0.81
□□□□□ -2.54
SCP1
Q08873
YGL258W-A
YGL258W-A
234 nt
-0.82
□□□□□ -2.54
SCP1
Q08873
tT(UGU)G1
tT(UGU)G1
72 nt
-0.82
□□□□□ -2.54
SCP1
Q08873
tT(UGU)G2
tT(UGU)G2
72 nt
-0.82
□□□□□ -2.54
SCP1
Q08873
tT(UGU)P
tT(UGU)P
72 nt
-0.82
□□□□□ -2.54
SCP1
Q08873
tT(UGU)Q1
tT(UGU)Q1
76 nt
-0.82
□□□□□ -2.54
SCP1
Q08873
YLR198C
YLR198C
360 nt
-0.82
□□□□□ -2.54
SCP1
Q08873
YLR399W-A
YLR399W-A
105 nt
-0.82
□□□□□ -2.54
SCP1
Q08873
YBR206W
YBR206W
324 nt
-0.82
□□□□□ -2.54
SCP1
Q08873
NIP1
YMR309C
2439 nt
-0.83
□□□□□ -2.54
SCP1
Q08873
DIE2
YGR227W
1578 nt
-0.83
□□□□□ -2.54
SCP1
Q08873
RUB1
YDR139C
234 nt
-0.83
□□□□□ -2.54
SCP1
Q08873
YKL023C-A
YKL023C-A
228 nt
-0.83
□□□□□ -2.54
SCP1
Q08873
YBR064W
YBR064W
429 nt
-0.83
□□□□□ -2.54
SCP1
Q08873
SUS1
YBR111W-A
291 nt
-0.83
□□□□□ -2.54
SCP1
Q08873
YBR121C-A
YBR121C-A
159 nt
-0.83
□□□□□ -2.54
SCP1
Q08873
YJL113W
YJL113W
4647 nt
-0.84
□□□□□ -2.54
SCP1
Q08873
15S_rRNA
15S_rRNA
1649 nt
-0.84
□□□□□ -2.54
SCP1
Q08873
HTB1
YDR224C
396 nt
-0.84
□□□□□ -2.54
SCP1
Q08873
YER138W-A
YER138W-A
105 nt
-0.84
□□□□□ -2.54
SCP1
Q08873
YFR012W-A
YFR012W-A
87 nt
-0.84
□□□□□ -2.54
SCP1
Q08873
BLS1
YLR408C
369 nt
-0.84
□□□□□ -2.54
SCP1
Q08873
YOR345C
YOR345C
351 nt
-0.84
□□□□□ -2.54
SCP1
Q08873
snR44
snR44
211 nt
-0.84
□□□□□ -2.54
SCP1
Q08873
RMD6
YEL072W
696 nt
-0.85
□□□□□ -2.55
SCP1
Q08873
DFG10
YIL049W
762 nt
-0.85
□□□□□ -2.55
SCP1
Q08873
SDS22
YKL193C
1017 nt
-0.85
□□□□□ -2.55
SCP1
Q08873
GSP1
YLR293C
660 nt
-0.85
□□□□□ -2.55
SCP1
Q08873
YMR290W-A
YMR290W-A
348 nt
-0.85
□□□□□ -2.55
SCP1
Q08873
PAA1
YDR071C
576 nt
-0.87
□□□□□ -2.55
SCP1
Q08873
YPL205C
YPL205C
345 nt
-0.87
□□□□□ -2.55
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