Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms