Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GABPB1Q06547 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
GABPB1Q06547 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
GABPB1Q06547 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
GABPB1Q06547 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
GABPB1Q06547 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
GABPB1Q06547 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
GABPB1Q06547 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABPB1Q06547 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms