Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN11Q06124 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN11Q06124 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms