Protein–RNA interactions for Protein: Q05900

YHC1, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHC1Q05900 SMC4YLR086W 4257 nt1.26□□□□□ -2.21
YHC1Q05900 BST1YFL025C 3090 nt1.26□□□□□ -2.21
YHC1Q05900 ZIP2YGL249W 2115 nt1.26□□□□□ -2.21
YHC1Q05900 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt1.26□□□□□ -2.21
YHC1Q05900 YJL022WYJL022W 309 nt1.26□□□□□ -2.21
YHC1Q05900 YLR140WYLR140W 327 nt1.26□□□□□ -2.21
YHC1Q05900 RPL38YLR325C 237 nt1.26□□□□□ -2.21
YHC1Q05900 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt1.26□□□□□ -2.21
YHC1Q05900 NOC3YLR002C 1992 nt1.26□□□□□ -2.21
YHC1Q05900 TBS1YBR150C 3285 nt1.26□□□□□ -2.21
YHC1Q05900 UFD2YDL190C 2886 nt1.26□□□□□ -2.21
YHC1Q05900 ADR1YDR216W 3972 nt1.25□□□□□ -2.21
YHC1Q05900 PCC1YKR095W-A 267 nt1.25□□□□□ -2.21
YHC1Q05900 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt1.25□□□□□ -2.21
YHC1Q05900 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt1.25□□□□□ -2.21
YHC1Q05900 YOR376WYOR376W 369 nt1.25□□□□□ -2.21
YHC1Q05900 AHC1YOR023C 1701 nt1.25□□□□□ -2.21
YHC1Q05900 APL2YKL135C 2181 nt1.25□□□□□ -2.21
YHC1Q05900 YLL054CYLL054C 2532 nt1.25□□□□□ -2.21
YHC1Q05900 MVP1YMR004W 1536 nt1.25□□□□□ -2.21
YHC1Q05900 snR72snR72 98 nt1.24□□□□□ -2.21
YHC1Q05900 YDR426CYDR426C 378 nt1.24□□□□□ -2.21
YHC1Q05900 RPS20YHL015W 366 nt1.24□□□□□ -2.21
YHC1Q05900 RPL40BYKR094C 387 nt1.24□□□□□ -2.21
YHC1Q05900 TIM18YOR297C 579 nt1.24□□□□□ -2.21
YHC1Q05900 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt1.24□□□□□ -2.21
YHC1Q05900 NUP192YJL039C 5052 nt1.24□□□□□ -2.21
YHC1Q05900 HKR1YDR420W 5409 nt1.23□□□□□ -2.21
YHC1Q05900 CSN9YDR179C 489 nt1.23□□□□□ -2.21
YHC1Q05900 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt1.23□□□□□ -2.21
YHC1Q05900 YJL135WYJL135W 318 nt1.23□□□□□ -2.21
YHC1Q05900 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.23□□□□□ -2.21
YHC1Q05900 YOR199WYOR199W 330 nt1.23□□□□□ -2.21
YHC1Q05900 ALK1YGL021W 2283 nt1.23□□□□□ -2.21
YHC1Q05900 KCS1YDR017C 3153 nt1.22□□□□□ -2.21
YHC1Q05900 KIP1YBL063W 3336 nt1.22□□□□□ -2.21
YHC1Q05900 PBY1YBR094W 2262 nt1.22□□□□□ -2.21
YHC1Q05900 SLX4YLR135W 2247 nt1.22□□□□□ -2.21
YHC1Q05900 VPS54YDR027C 2670 nt1.22□□□□□ -2.21
YHC1Q05900 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.22□□□□□ -2.21
YHC1Q05900 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.22□□□□□ -2.21
YHC1Q05900 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.22□□□□□ -2.21
YHC1Q05900 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.22□□□□□ -2.21
YHC1Q05900 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.22□□□□□ -2.21
YHC1Q05900 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.22□□□□□ -2.21
YHC1Q05900 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.22□□□□□ -2.21
YHC1Q05900 YGL217CYGL217C 342 nt1.22□□□□□ -2.21
YHC1Q05900 ENV11YGR071C 2583 nt1.22□□□□□ -2.21
YHC1Q05900 SPC98YNL126W 2541 nt1.22□□□□□ -2.21
YHC1Q05900 NPC2YDL046W 522 nt1.21□□□□□ -2.22
YHC1Q05900 YOL160WYOL160W 342 nt1.21□□□□□ -2.22
YHC1Q05900 SCW11YGL028C 1629 nt1.21□□□□□ -2.22
YHC1Q05900 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt1.2□□□□□ -2.22
YHC1Q05900 VPS55YJR044C 423 nt1.2□□□□□ -2.22
YHC1Q05900 HTB2YBL002W 396 nt1.2□□□□□ -2.22
YHC1Q05900 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt1.2□□□□□ -2.22
YHC1Q05900 RPL33BYOR234C 324 nt1.2□□□□□ -2.22
YHC1Q05900 MAD1YGL086W 2250 nt1.2□□□□□ -2.22
YHC1Q05900 RPL35AYDL191W 363 nt1.19□□□□□ -2.22
YHC1Q05900 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt1.19□□□□□ -2.22
YHC1Q05900 AIM44YPL158C 2277 nt1.19□□□□□ -2.22
YHC1Q05900 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.18□□□□□ -2.22
YHC1Q05900 YJL015CYJL015C 285 nt1.18□□□□□ -2.22
YHC1Q05900 AZF1YOR113W 2745 nt1.17□□□□□ -2.22
YHC1Q05900 SLI15YBR156C 2097 nt1.17□□□□□ -2.22
YHC1Q05900 SEC21YNL287W 2808 nt1.17□□□□□ -2.22
YHC1Q05900 CDC36YDL165W 576 nt1.17□□□□□ -2.22
YHC1Q05900 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt1.17□□□□□ -2.22
YHC1Q05900 YAF9YNL107W 681 nt1.17□□□□□ -2.22
YHC1Q05900 PMD1YER132C 5262 nt1.16□□□□□ -2.22
YHC1Q05900 KAP122YGL016W 3246 nt1.16□□□□□ -2.22
YHC1Q05900 NUT1YGL151W 3399 nt1.16□□□□□ -2.22
YHC1Q05900 RAD34YDR314C 2079 nt1.16□□□□□ -2.22
YHC1Q05900 MPT5YGL178W 2580 nt1.15□□□□□ -2.22
YHC1Q05900 EST2YLR318W 2655 nt1.15□□□□□ -2.22
YHC1Q05900 YDL211CYDL211C 1119 nt1.15□□□□□ -2.23
YHC1Q05900 LCD1YDR499W 2244 nt1.15□□□□□ -2.23
YHC1Q05900 YDR048CYDR048C 315 nt1.14□□□□□ -2.23
YHC1Q05900 YDR102CYDR102C 333 nt1.14□□□□□ -2.23
YHC1Q05900 MAM33YIL070C 801 nt1.14□□□□□ -2.23
YHC1Q05900 YAR029WYAR029W 225 nt1.14□□□□□ -2.23
YHC1Q05900 TAR1YLR154W-C 375 nt1.14□□□□□ -2.23
YHC1Q05900 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.14□□□□□ -2.23
YHC1Q05900 YSY6YBR162W-A 198 nt1.14□□□□□ -2.23
YHC1Q05900 CUL3YGR003W 2235 nt1.13□□□□□ -2.23
YHC1Q05900 COG4YPR105C 2586 nt1.13□□□□□ -2.23
YHC1Q05900 Q0142Q0142 177 nt1.13□□□□□ -2.23
YHC1Q05900 YIR044CYIR044C 186 nt1.13□□□□□ -2.23
YHC1Q05900 snR14snR14 160 nt1.13□□□□□ -2.23
YHC1Q05900 PKH2YOL100W 3246 nt1.13□□□□□ -2.23
YHC1Q05900 PIP2YOR363C 2991 nt1.12□□□□□ -2.23
YHC1Q05900 SPT21YMR179W 2277 nt1.12□□□□□ -2.23
YHC1Q05900 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt1.12□□□□□ -2.23
YHC1Q05900 YKL136WYKL136W 399 nt1.12□□□□□ -2.23
YHC1Q05900 MMS4YBR098W 2076 nt1.12□□□□□ -2.23
YHC1Q05900 MSH3YCR092C 3057 nt1.11□□□□□ -2.23
YHC1Q05900 YPL225WYPL225W 441 nt1.11□□□□□ -2.23
YHC1Q05900 snR36snR36 182 nt1.11□□□□□ -2.23
YHC1Q05900 FIG2YCR089W 4830 nt1.11□□□□□ -2.23
YHC1Q05900 LAA1YJL207C 6045 nt1.1□□□□□ -2.23
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