Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN12Q05209 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms