Protein–RNA interactions for Protein: Q04116

YHP1, Homeobox protein YHP1, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHP1Q04116 YOL029CYOL029C 606 nt0.45□□□□□ -2.34
YHP1Q04116 IRC16YPR038W 360 nt0.45□□□□□ -2.34
YHP1Q04116 ENV11YGR071C 2583 nt0.45□□□□□ -2.34
YHP1Q04116 DBP6YNR038W 1890 nt0.44□□□□□ -2.34
YHP1Q04116 YIL029CYIL029C 429 nt0.44□□□□□ -2.34
YHP1Q04116 PRP21YJL203W 843 nt0.44□□□□□ -2.34
YHP1Q04116 RPL32YBL092W 393 nt0.44□□□□□ -2.34
YHP1Q04116 YML002WYML002W 2214 nt0.44□□□□□ -2.34
YHP1Q04116 SLI15YBR156C 2097 nt0.43□□□□□ -2.34
YHP1Q04116 MET32YDR253C 576 nt0.43□□□□□ -2.34
YHP1Q04116 YER076W-AYER076W-A 348 nt0.43□□□□□ -2.34
YHP1Q04116 YGR042WYGR042W 816 nt0.43□□□□□ -2.34
YHP1Q04116 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt0.43□□□□□ -2.34
YHP1Q04116 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt0.43□□□□□ -2.34
YHP1Q04116 YPR153WYPR153W 423 nt0.43□□□□□ -2.34
YHP1Q04116 YCK3YER123W 1575 nt0.43□□□□□ -2.34
YHP1Q04116 RFX1YLR176C 2436 nt0.43□□□□□ -2.34
YHP1Q04116 ALY2YJL084C 3141 nt0.42□□□□□ -2.34
YHP1Q04116 NPC2YDL046W 522 nt0.42□□□□□ -2.34
YHP1Q04116 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt0.42□□□□□ -2.34
YHP1Q04116 YIL059CYIL059C 366 nt0.42□□□□□ -2.34
YHP1Q04116 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt0.42□□□□□ -2.34
YHP1Q04116 RPL38YLR325C 237 nt0.42□□□□□ -2.34
YHP1Q04116 VMA21YGR105W 234 nt0.41□□□□□ -2.34
YHP1Q04116 QCR9YGR183C 201 nt0.41□□□□□ -2.34
YHP1Q04116 PAU12YGR294W 363 nt0.41□□□□□ -2.34
YHP1Q04116 ECM12YHR021W-A 456 nt0.41□□□□□ -2.34
YHP1Q04116 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.41□□□□□ -2.34
YHP1Q04116 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt0.41□□□□□ -2.34
YHP1Q04116 YOR218CYOR218C 420 nt0.41□□□□□ -2.34
YHP1Q04116 ULP2YIL031W 3105 nt0.41□□□□□ -2.34
YHP1Q04116 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt0.4□□□□□ -2.35
YHP1Q04116 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.4□□□□□ -2.35
YHP1Q04116 YSP1YHR155W 3687 nt0.39□□□□□ -2.35
YHP1Q04116 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt0.39□□□□□ -2.35
YHP1Q04116 BFR2YDR299W 1605 nt0.38□□□□□ -2.35
YHP1Q04116 FMP27YLR454W 7887 nt0.38□□□□□ -2.35
YHP1Q04116 YDR269CYDR269C 324 nt0.38□□□□□ -2.35
YHP1Q04116 YER135CYER135C 393 nt0.38□□□□□ -2.35
YHP1Q04116 YKL044WYKL044W 321 nt0.38□□□□□ -2.35
YHP1Q04116 RCN2YOR220W 798 nt0.38□□□□□ -2.35
YHP1Q04116 LTE1YAL024C 4308 nt0.38□□□□□ -2.35
YHP1Q04116 YLL007CYLL007C 1998 nt0.37□□□□□ -2.35
YHP1Q04116 ISD11YER048W-A 285 nt0.37□□□□□ -2.35
YHP1Q04116 HUR1YGL168W 333 nt0.37□□□□□ -2.35
YHP1Q04116 APQ13YJL075C 417 nt0.37□□□□□ -2.35
YHP1Q04116 ZIP2YGL249W 2115 nt0.37□□□□□ -2.35
YHP1Q04116 YGL239CYGL239C 315 nt0.36□□□□□ -2.35
YHP1Q04116 YOL014WYOL014W 375 nt0.36□□□□□ -2.35
YHP1Q04116 WIP1YDR374W-A 270 nt0.35□□□□□ -2.35
YHP1Q04116 YGR025WYGR025W 303 nt0.35□□□□□ -2.35
YHP1Q04116 BER1YLR412W 825 nt0.35□□□□□ -2.35
YHP1Q04116 GPG1YGL121C 381 nt0.34□□□□□ -2.36
YHP1Q04116 RPL9AYGL147C 576 nt0.34□□□□□ -2.36
YHP1Q04116 Q0255Q0255 1419 nt0.34□□□□□ -2.36
YHP1Q04116 SVS1YPL163C 783 nt0.34□□□□□ -2.36
YHP1Q04116 EFR3YMR212C 2349 nt0.33□□□□□ -2.36
YHP1Q04116 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt0.33□□□□□ -2.36
YHP1Q04116 snR13snR13 124 nt0.33□□□□□ -2.36
YHP1Q04116 AI1Q0050 2505 nt0.33□□□□□ -2.36
YHP1Q04116 PAN2YGL094C 3348 nt0.32□□□□□ -2.36
YHP1Q04116 PKH2YOL100W 3246 nt0.32□□□□□ -2.36
YHP1Q04116 YDR344CYDR344C 444 nt0.32□□□□□ -2.36
YHP1Q04116 YJR141WYJR141W 1044 nt0.32□□□□□ -2.36
YHP1Q04116 LOA1YPR139C 903 nt0.32□□□□□ -2.36
YHP1Q04116 TRS65YGR166W 1683 nt0.32□□□□□ -2.36
YHP1Q04116 CHS6YJL099W 2241 nt0.32□□□□□ -2.36
YHP1Q04116 NPR2YEL062W 1848 nt0.31□□□□□ -2.36
YHP1Q04116 YJL135WYJL135W 318 nt0.31□□□□□ -2.36
YHP1Q04116 YOR282WYOR282W 321 nt0.31□□□□□ -2.36
YHP1Q04116 SNU56YDR240C 1479 nt0.3□□□□□ -2.36
YHP1Q04116 PMP1YCR024C-A 123 nt0.3□□□□□ -2.36
YHP1Q04116 UBX4YMR067C 1251 nt0.3□□□□□ -2.36
YHP1Q04116 CDC33YOL139C 642 nt0.3□□□□□ -2.36
YHP1Q04116 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.3□□□□□ -2.36
YHP1Q04116 RPB10YOR210W 213 nt0.3□□□□□ -2.36
YHP1Q04116 YDL016CYDL016C 303 nt0.29□□□□□ -2.36
YHP1Q04116 YDR029WYDR029W 315 nt0.29□□□□□ -2.36
YHP1Q04116 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt0.29□□□□□ -2.36
YHP1Q04116 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.29□□□□□ -2.36
YHP1Q04116 RPS27AYKL156W 249 nt0.29□□□□□ -2.36
YHP1Q04116 ABF2YMR072W 552 nt0.29□□□□□ -2.36
YHP1Q04116 TSC3YBR058C-A 243 nt0.29□□□□□ -2.36
YHP1Q04116 RPL26BYGR034W 384 nt0.28□□□□□ -2.36
YHP1Q04116 YHL042WYHL042W 453 nt0.28□□□□□ -2.36
YHP1Q04116 RPS24BYIL069C 408 nt0.28□□□□□ -2.36
YHP1Q04116 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.28□□□□□ -2.36
YHP1Q04116 NOP9YJL010C 2001 nt0.28□□□□□ -2.37
YHP1Q04116 IQG1YPL242C 4488 nt0.28□□□□□ -2.37
YHP1Q04116 UBC7YMR022W 498 nt0.27□□□□□ -2.37
YHP1Q04116 ISF1YMR081C 1017 nt0.27□□□□□ -2.37
YHP1Q04116 HMLALPHA2YCL067C 633 nt0.26□□□□□ -2.37
YHP1Q04116 MATALPHA2YCR039C 633 nt0.26□□□□□ -2.37
YHP1Q04116 snR72snR72 98 nt0.26□□□□□ -2.37
YHP1Q04116 BIG1YHR101C 1008 nt0.25□□□□□ -2.37
YHP1Q04116 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.24□□□□□ -2.37
YHP1Q04116 BSC3YLR465C 309 nt0.24□□□□□ -2.37
YHP1Q04116 YOL160WYOL160W 342 nt0.24□□□□□ -2.37
YHP1Q04116 YPL182CYPL182C 384 nt0.24□□□□□ -2.37
YHP1Q04116 SBH1YER087C-B 249 nt0.23□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 89.7 ms