Protein–RNA interactions for Protein: Q04006

UPS3, Protein UPS3, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UPS3Q04006 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.49□□□□□ -2.33
UPS3Q04006 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.49□□□□□ -2.33
UPS3Q04006 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.49□□□□□ -2.33
UPS3Q04006 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.49□□□□□ -2.33
UPS3Q04006 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.49□□□□□ -2.33
UPS3Q04006 YIL059CYIL059C 366 nt0.49□□□□□ -2.33
UPS3Q04006 ILM1YJR118C 612 nt0.49□□□□□ -2.33
UPS3Q04006 YPR153WYPR153W 423 nt0.49□□□□□ -2.33
UPS3Q04006 MMS4YBR098W 2076 nt0.49□□□□□ -2.33
UPS3Q04006 PHS1YJL097W 654 nt0.48□□□□□ -2.33
UPS3Q04006 NPC2YDL046W 522 nt0.47□□□□□ -2.33
UPS3Q04006 MET32YDR253C 576 nt0.47□□□□□ -2.33
UPS3Q04006 YNL319WYNL319W 441 nt0.47□□□□□ -2.33
UPS3Q04006 YDR269CYDR269C 324 nt0.46□□□□□ -2.34
UPS3Q04006 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt0.46□□□□□ -2.34
UPS3Q04006 WAR1YML076C 2835 nt0.46□□□□□ -2.34
UPS3Q04006 SLI15YBR156C 2097 nt0.45□□□□□ -2.34
UPS3Q04006 LTE1YAL024C 4308 nt0.45□□□□□ -2.34
UPS3Q04006 YDR029WYDR029W 315 nt0.45□□□□□ -2.34
UPS3Q04006 ALG13YGL047W 609 nt0.45□□□□□ -2.34
UPS3Q04006 STF2YGR008C 255 nt0.45□□□□□ -2.34
UPS3Q04006 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt0.45□□□□□ -2.34
UPS3Q04006 URM1YIL008W 300 nt0.45□□□□□ -2.34
UPS3Q04006 YOR029WYOR029W 336 nt0.45□□□□□ -2.34
UPS3Q04006 COG4YPR105C 2586 nt0.45□□□□□ -2.34
UPS3Q04006 YJR003CYJR003C 1560 nt0.45□□□□□ -2.34
UPS3Q04006 HMLALPHA2YCL067C 633 nt0.44□□□□□ -2.34
UPS3Q04006 MATALPHA2YCR039C 633 nt0.44□□□□□ -2.34
UPS3Q04006 TSC3YBR058C-A 243 nt0.44□□□□□ -2.34
UPS3Q04006 BFR2YDR299W 1605 nt0.43□□□□□ -2.34
UPS3Q04006 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt0.43□□□□□ -2.34
UPS3Q04006 ZIP2YGL249W 2115 nt0.43□□□□□ -2.34
UPS3Q04006 DBP6YNR038W 1890 nt0.42□□□□□ -2.34
UPS3Q04006 NFU1YKL040C 771 nt0.42□□□□□ -2.34
UPS3Q04006 YKL123WYKL123W 381 nt0.42□□□□□ -2.34
UPS3Q04006 RPL38YLR325C 237 nt0.42□□□□□ -2.34
UPS3Q04006 HUG1YML058W-A 207 nt0.42□□□□□ -2.34
UPS3Q04006 IES4YOR189W 351 nt0.42□□□□□ -2.34
UPS3Q04006 LOA1YPR139C 903 nt0.42□□□□□ -2.34
UPS3Q04006 GEA2YEL022W 4380 nt0.42□□□□□ -2.34
UPS3Q04006 UTP10YJL109C 5310 nt0.42□□□□□ -2.34
UPS3Q04006 PAN2YGL094C 3348 nt0.42□□□□□ -2.34
UPS3Q04006 RPL9AYGL147C 576 nt0.41□□□□□ -2.34
UPS3Q04006 YHL042WYHL042W 453 nt0.41□□□□□ -2.34
UPS3Q04006 YJL135WYJL135W 318 nt0.41□□□□□ -2.34
UPS3Q04006 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.41□□□□□ -2.34
UPS3Q04006 RPS30BYOR182C 192 nt0.41□□□□□ -2.34
UPS3Q04006 OST1YJL002C 1431 nt0.4□□□□□ -2.34
UPS3Q04006 YMR160WYMR160W 2451 nt0.4□□□□□ -2.35
UPS3Q04006 YCR001WYCR001W 315 nt0.4□□□□□ -2.35
UPS3Q04006 ISD11YER048W-A 285 nt0.4□□□□□ -2.35
UPS3Q04006 ECM12YHR021W-A 456 nt0.4□□□□□ -2.35
UPS3Q04006 INA22YIR024C 651 nt0.4□□□□□ -2.35
UPS3Q04006 YLR269CYLR269C 351 nt0.4□□□□□ -2.35
UPS3Q04006 PAC1YOR269W 1485 nt0.4□□□□□ -2.35
UPS3Q04006 WIP1YDR374W-A 270 nt0.39□□□□□ -2.35
UPS3Q04006 GPI15YNL038W 690 nt0.39□□□□□ -2.35
UPS3Q04006 EFR3YMR212C 2349 nt0.39□□□□□ -2.35
UPS3Q04006 GPG1YGL121C 381 nt0.38□□□□□ -2.35
UPS3Q04006 RPF1YHR088W 888 nt0.38□□□□□ -2.35
UPS3Q04006 BIG1YHR101C 1008 nt0.38□□□□□ -2.35
UPS3Q04006 YPL182CYPL182C 384 nt0.38□□□□□ -2.35
UPS3Q04006 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.37□□□□□ -2.35
UPS3Q04006 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.37□□□□□ -2.35
UPS3Q04006 YOL160WYOL160W 342 nt0.37□□□□□ -2.35
UPS3Q04006 NOP9YJL010C 2001 nt0.37□□□□□ -2.35
UPS3Q04006 PMP1YCR024C-A 123 nt0.36□□□□□ -2.35
UPS3Q04006 snR72snR72 98 nt0.36□□□□□ -2.35
UPS3Q04006 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.36□□□□□ -2.35
UPS3Q04006 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt0.36□□□□□ -2.35
UPS3Q04006 CHS6YJL099W 2241 nt0.36□□□□□ -2.35
UPS3Q04006 YER084W-AYER084W-A 513 nt0.35□□□□□ -2.35
UPS3Q04006 TIM13YGR181W 318 nt0.35□□□□□ -2.35
UPS3Q04006 YKL202WYKL202W 582 nt0.35□□□□□ -2.35
UPS3Q04006 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.35□□□□□ -2.35
UPS3Q04006 PKH2YOL100W 3246 nt0.35□□□□□ -2.35
UPS3Q04006 RAD34YDR314C 2079 nt0.34□□□□□ -2.35
UPS3Q04006 YLL007CYLL007C 1998 nt0.34□□□□□ -2.35
UPS3Q04006 YDR344CYDR344C 444 nt0.34□□□□□ -2.36
UPS3Q04006 RPS27AYKL156W 249 nt0.34□□□□□ -2.36
UPS3Q04006 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.34□□□□□ -2.36
UPS3Q04006 CDC33YOL139C 642 nt0.34□□□□□ -2.36
UPS3Q04006 RPB10YOR210W 213 nt0.34□□□□□ -2.36
UPS3Q04006 UTP20YBL004W 7482 nt0.34□□□□□ -2.36
UPS3Q04006 YSP1YHR155W 3687 nt0.34□□□□□ -2.36
UPS3Q04006 UBC7YMR022W 498 nt0.33□□□□□ -2.36
UPS3Q04006 PBI2YNL015W 228 nt0.33□□□□□ -2.36
UPS3Q04006 YOR282WYOR282W 321 nt0.33□□□□□ -2.36
UPS3Q04006 YPL261CYPL261C 309 nt0.33□□□□□ -2.36
UPS3Q04006 YCK3YER123W 1575 nt0.32□□□□□ -2.36
UPS3Q04006 NPR2YEL062W 1848 nt0.32□□□□□ -2.36
UPS3Q04006 EMC4YGL231C 573 nt0.32□□□□□ -2.36
UPS3Q04006 STE18YJR086W 333 nt0.32□□□□□ -2.36
UPS3Q04006 YBL071CYBL071C 309 nt0.32□□□□□ -2.36
UPS3Q04006 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt0.32□□□□□ -2.36
UPS3Q04006 YBR064WYBR064W 429 nt0.32□□□□□ -2.36
UPS3Q04006 snR51snR51 107 nt0.32□□□□□ -2.36
UPS3Q04006 YDL011CYDL011C 324 nt0.31□□□□□ -2.36
UPS3Q04006 EAF6YJR082C 342 nt0.31□□□□□ -2.36
UPS3Q04006 YOR218CYOR218C 420 nt0.31□□□□□ -2.36
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