Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CREMQ03060 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CREMQ03060 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CREMQ03060 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CREMQ03060 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CREMQ03060 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CREMQ03060 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CREMQ03060 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CREMQ03060 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CREMQ03060 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CREMQ03060 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CREMQ03060 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CREMQ03060 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CREMQ03060 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CREMQ03060 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CREMQ03060 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CREMQ03060 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CREMQ03060 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CREMQ03060 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CREMQ03060 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CREMQ03060 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CREMQ03060 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CREMQ03060 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CREMQ03060 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CREMQ03060 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CREMQ03060 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CREMQ03060 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CREMQ03060 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CREMQ03060 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CREMQ03060 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CREMQ03060 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CREMQ03060 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREMQ03060 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREMQ03060 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREMQ03060 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREMQ03060 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREMQ03060 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREMQ03060 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CREMQ03060 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREMQ03060 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREMQ03060 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CREMQ03060 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREMQ03060 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREMQ03060 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREMQ03060 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREMQ03060 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREMQ03060 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREMQ03060 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREMQ03060 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREMQ03060 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CREMQ03060 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREMQ03060 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREMQ03060 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREMQ03060 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREMQ03060 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CREMQ03060 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREMQ03060 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREMQ03060 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREMQ03060 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREMQ03060 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREMQ03060 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREMQ03060 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREMQ03060 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREMQ03060 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREMQ03060 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREMQ03060 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREMQ03060 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREMQ03060 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREMQ03060 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CREMQ03060 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CREMQ03060 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CREMQ03060 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CREMQ03060 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CREMQ03060 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CREMQ03060 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CREMQ03060 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CREMQ03060 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CREMQ03060 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CREMQ03060 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CREMQ03060 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CREMQ03060 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CREMQ03060 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CREMQ03060 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CREMQ03060 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CREMQ03060 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREMQ03060 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREMQ03060 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CREMQ03060 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREMQ03060 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREMQ03060 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREMQ03060 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREMQ03060 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREMQ03060 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREMQ03060 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CREMQ03060 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREMQ03060 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREMQ03060 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CREMQ03060 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREMQ03060 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREMQ03060 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms