Protein–RNA interactions for Protein: Q02959

HOS3, Histone deacetylase HOS3, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 697 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HOS3Q02959 YBR174CYBR174C 315 nt2.59□□□□□ -1.99
HOS3Q02959 ZRG8YER033C 3231 nt2.59□□□□□ -1.99
HOS3Q02959 UBP1YDL122W 2430 nt2.59□□□□□ -2
HOS3Q02959 SPO21YOL091W 1830 nt2.58□□□□□ -2
HOS3Q02959 MSC6YOR354C 2079 nt2.58□□□□□ -2
HOS3Q02959 YCR043CYCR043C 384 nt2.58□□□□□ -2
HOS3Q02959 EMP24YGL200C 612 nt2.58□□□□□ -2
HOS3Q02959 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.58□□□□□ -2
HOS3Q02959 ELG1YOR144C 2376 nt2.58□□□□□ -2
HOS3Q02959 ISW1YBR245C 3390 nt2.58□□□□□ -2
HOS3Q02959 PDR3YBL005W 2931 nt2.58□□□□□ -2
HOS3Q02959 PSD2YGR170W 3417 nt2.57□□□□□ -2
HOS3Q02959 MSB1YOR188W 3414 nt2.57□□□□□ -2
HOS3Q02959 FAR11YNL127W 2862 nt2.57□□□□□ -2
HOS3Q02959 SNU13YEL026W 381 nt2.57□□□□□ -2
HOS3Q02959 RPS29AYLR388W 171 nt2.57□□□□□ -2
HOS3Q02959 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt2.57□□□□□ -2
HOS3Q02959 MNE1YOR350C 1992 nt2.57□□□□□ -2
HOS3Q02959 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.56□□□□□ -2
HOS3Q02959 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.56□□□□□ -2
HOS3Q02959 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.56□□□□□ -2
HOS3Q02959 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.56□□□□□ -2
HOS3Q02959 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.56□□□□□ -2
HOS3Q02959 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.56□□□□□ -2
HOS3Q02959 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.56□□□□□ -2
HOS3Q02959 YJL120WYJL120W 324 nt2.56□□□□□ -2
HOS3Q02959 YNL018CYNL018C 1839 nt2.56□□□□□ -2
HOS3Q02959 SCD5YOR329C 2619 nt2.55□□□□□ -2
HOS3Q02959 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt2.55□□□□□ -2
HOS3Q02959 RPL34BYIL052C 366 nt2.55□□□□□ -2
HOS3Q02959 YIR044CYIR044C 186 nt2.55□□□□□ -2
HOS3Q02959 IRA2YOL081W 9240 nt2.55□□□□□ -2
HOS3Q02959 YCL046WYCL046W 324 nt2.55□□□□□ -2
HOS3Q02959 SAP185YJL098W 3177 nt2.55□□□□□ -2
HOS3Q02959 RPS25BYLR333C 327 nt2.54□□□□□ -2
HOS3Q02959 ACM1YPL267W 630 nt2.54□□□□□ -2
HOS3Q02959 EDS1YBR033W 2760 nt2.53□□□□□ -2
HOS3Q02959 VTC3YPL019C 2508 nt2.52□□□□□ -2.01
HOS3Q02959 YLL007CYLL007C 1998 nt2.52□□□□□ -2.01
HOS3Q02959 YHR210CYHR210C 1026 nt2.52□□□□□ -2.01
HOS3Q02959 NUP100YKL068W 2880 nt2.52□□□□□ -2.01
HOS3Q02959 COY1YKL179C 2040 nt2.52□□□□□ -2.01
HOS3Q02959 CSF1YLR087C 8877 nt2.51□□□□□ -2.01
HOS3Q02959 KRE33YNL132W 3171 nt2.51□□□□□ -2.01
HOS3Q02959 TFC3YAL001C 3483 nt2.51□□□□□ -2.01
HOS3Q02959 RLM1YPL089C 2031 nt2.51□□□□□ -2.01
HOS3Q02959 INO80YGL150C 4470 nt2.51□□□□□ -2.01
HOS3Q02959 PUT3YKL015W 2940 nt2.51□□□□□ -2.01
HOS3Q02959 SSD1YDR293C 3753 nt2.5□□□□□ -2.01
HOS3Q02959 TOF1YNL273W 3717 nt2.5□□□□□ -2.01
HOS3Q02959 ZRG17YNR039C 1818 nt2.5□□□□□ -2.01
HOS3Q02959 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt2.5□□□□□ -2.01
HOS3Q02959 YDL196WYDL196W 330 nt2.49□□□□□ -2.01
HOS3Q02959 ATP7YKL016C 525 nt2.49□□□□□ -2.01
HOS3Q02959 UBP2YOR124C 3819 nt2.49□□□□□ -2.01
HOS3Q02959 PAU3YCR104W 375 nt2.48□□□□□ -2.01
HOS3Q02959 TFC8YPL007C 1767 nt2.48□□□□□ -2.01
HOS3Q02959 FKS3YMR306W 5358 nt2.48□□□□□ -2.01
HOS3Q02959 NOP14YDL148C 2433 nt2.48□□□□□ -2.01
HOS3Q02959 RAD34YDR314C 2079 nt2.48□□□□□ -2.01
HOS3Q02959 NAM7YMR080C 2916 nt2.48□□□□□ -2.01
HOS3Q02959 NCA2YPR155C 1851 nt2.48□□□□□ -2.01
HOS3Q02959 ATG11YPR049C 3537 nt2.47□□□□□ -2.01
HOS3Q02959 PDR11YIL013C 4236 nt2.47□□□□□ -2.01
HOS3Q02959 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt2.47□□□□□ -2.01
HOS3Q02959 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt2.47□□□□□ -2.01
HOS3Q02959 DGR1YNL130C-A 147 nt2.47□□□□□ -2.01
HOS3Q02959 CAT2YML042W 2013 nt2.47□□□□□ -2.01
HOS3Q02959 YFR016CYFR016C 3702 nt2.47□□□□□ -2.01
HOS3Q02959 SIR3YLR442C 2937 nt2.46□□□□□ -2.02
HOS3Q02959 SPP41YDR464W 4308 nt2.46□□□□□ -2.02
HOS3Q02959 ZIP2YGL249W 2115 nt2.46□□□□□ -2.02
HOS3Q02959 NOC3YLR002C 1992 nt2.46□□□□□ -2.02
HOS3Q02959 UFD4YKL010C 4452 nt2.46□□□□□ -2.02
HOS3Q02959 HSH155YMR288W 2916 nt2.46□□□□□ -2.02
HOS3Q02959 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt2.45□□□□□ -2.02
HOS3Q02959 FIG4YNL325C 2640 nt2.45□□□□□ -2.02
HOS3Q02959 STH1YIL126W 4080 nt2.45□□□□□ -2.02
HOS3Q02959 HAL9YOL089C 3093 nt2.45□□□□□ -2.02
HOS3Q02959 MET18YIL128W 3099 nt2.44□□□□□ -2.02
HOS3Q02959 ENV11YGR071C 2583 nt2.44□□□□□ -2.02
HOS3Q02959 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt2.44□□□□□ -2.02
HOS3Q02959 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.44□□□□□ -2.02
HOS3Q02959 ZIP1YDR285W 2628 nt2.44□□□□□ -2.02
HOS3Q02959 SAS3YBL052C 2496 nt2.43□□□□□ -2.02
HOS3Q02959 RPL31AYDL075W 342 nt2.43□□□□□ -2.02
HOS3Q02959 YBL109WYBL109W 336 nt2.43□□□□□ -2.02
HOS3Q02959 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt2.43□□□□□ -2.02
HOS3Q02959 MAD1YGL086W 2250 nt2.42□□□□□ -2.02
HOS3Q02959 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.42□□□□□ -2.02
HOS3Q02959 SMC6YLR383W 3345 nt2.42□□□□□ -2.02
HOS3Q02959 AIM44YPL158C 2277 nt2.42□□□□□ -2.02
HOS3Q02959 APL5YPL195W 2799 nt2.41□□□□□ -2.02
HOS3Q02959 BRP1YGL007W 378 nt2.41□□□□□ -2.02
HOS3Q02959 VPS8YAL002W 3825 nt2.41□□□□□ -2.02
HOS3Q02959 AHC1YOR023C 1701 nt2.4□□□□□ -2.02
HOS3Q02959 TIM9YEL020W-A 264 nt2.4□□□□□ -2.03
HOS3Q02959 PIG1YLR273C 1947 nt2.4□□□□□ -2.03
HOS3Q02959 UBR1YGR184C 5853 nt2.4□□□□□ -2.03
HOS3Q02959 DCP2YNL118C 2913 nt2.39□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 32.2 ms