Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCNT1Q02742 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCNT1Q02742 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms