Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
OTUD4Q01804 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
OTUD4Q01804 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms