Protein–RNA interactions for Protein: Q01167

FOXK2, Forkhead box protein K2, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXK2Q01167 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXK2Q01167 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXK2Q01167 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXK2Q01167 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXK2Q01167 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXK2Q01167 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXK2Q01167 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXK2Q01167 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXK2Q01167 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXK2Q01167 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXK2Q01167 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXK2Q01167 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXK2Q01167 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXK2Q01167 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXK2Q01167 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXK2Q01167 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXK2Q01167 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXK2Q01167 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXK2Q01167 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXK2Q01167 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXK2Q01167 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXK2Q01167 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXK2Q01167 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXK2Q01167 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms