Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F1Q01094 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms