Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PRCDQ00LT1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms