Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms