Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COG7P83436 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COG7P83436 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COG7P83436 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COG7P83436 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COG7P83436 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COG7P83436 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COG7P83436 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COG7P83436 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COG7P83436 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COG7P83436 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COG7P83436 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COG7P83436 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COG7P83436 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COG7P83436 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COG7P83436 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COG7P83436 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COG7P83436 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COG7P83436 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COG7P83436 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COG7P83436 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COG7P83436 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COG7P83436 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COG7P83436 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COG7P83436 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COG7P83436 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
COG7P83436 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COG7P83436 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
COG7P83436 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
COG7P83436 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
COG7P83436 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COG7P83436 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COG7P83436 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COG7P83436 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COG7P83436 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COG7P83436 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
COG7P83436 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COG7P83436 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COG7P83436 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COG7P83436 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COG7P83436 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COG7P83436 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COG7P83436 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COG7P83436 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COG7P83436 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COG7P83436 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COG7P83436 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COG7P83436 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COG7P83436 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
COG7P83436 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COG7P83436 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COG7P83436 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COG7P83436 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COG7P83436 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COG7P83436 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COG7P83436 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COG7P83436 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COG7P83436 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COG7P83436 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COG7P83436 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COG7P83436 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COG7P83436 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COG7P83436 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
COG7P83436 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
COG7P83436 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COG7P83436 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COG7P83436 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COG7P83436 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COG7P83436 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COG7P83436 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COG7P83436 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COG7P83436 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COG7P83436 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COG7P83436 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COG7P83436 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COG7P83436 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COG7P83436 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COG7P83436 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COG7P83436 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COG7P83436 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COG7P83436 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COG7P83436 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COG7P83436 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COG7P83436 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COG7P83436 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COG7P83436 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COG7P83436 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COG7P83436 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COG7P83436 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COG7P83436 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COG7P83436 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COG7P83436 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COG7P83436 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COG7P83436 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COG7P83436 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COG7P83436 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COG7P83436 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COG7P83436 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COG7P83436 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COG7P83436 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms