Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPM4P67936 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPM4P67936 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPM4P67936 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPM4P67936 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPM4P67936 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPM4P67936 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPM4P67936 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPM4P67936 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPM4P67936 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPM4P67936 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPM4P67936 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPM4P67936 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TPM4P67936 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPM4P67936 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPM4P67936 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPM4P67936 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPM4P67936 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPM4P67936 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPM4P67936 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPM4P67936 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPM4P67936 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPM4P67936 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPM4P67936 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPM4P67936 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TPM4P67936 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPM4P67936 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPM4P67936 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPM4P67936 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPM4P67936 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPM4P67936 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPM4P67936 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPM4P67936 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPM4P67936 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPM4P67936 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPM4P67936 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPM4P67936 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPM4P67936 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPM4P67936 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPM4P67936 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPM4P67936 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPM4P67936 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TPM4P67936 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPM4P67936 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPM4P67936 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPM4P67936 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPM4P67936 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPM4P67936 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPM4P67936 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPM4P67936 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPM4P67936 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPM4P67936 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPM4P67936 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPM4P67936 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPM4P67936 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPM4P67936 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPM4P67936 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPM4P67936 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPM4P67936 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPM4P67936 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPM4P67936 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPM4P67936 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPM4P67936 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPM4P67936 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPM4P67936 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPM4P67936 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPM4P67936 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPM4P67936 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPM4P67936 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPM4P67936 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TPM4P67936 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPM4P67936 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPM4P67936 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPM4P67936 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPM4P67936 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPM4P67936 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPM4P67936 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPM4P67936 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPM4P67936 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TPM4P67936 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPM4P67936 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPM4P67936 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPM4P67936 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPM4P67936 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPM4P67936 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPM4P67936 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPM4P67936 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPM4P67936 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPM4P67936 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPM4P67936 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPM4P67936 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPM4P67936 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPM4P67936 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPM4P67936 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPM4P67936 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPM4P67936 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPM4P67936 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPM4P67936 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPM4P67936 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPM4P67936 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms