Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPS29P62273 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPS29P62273 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPS29P62273 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RPS29P62273 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RPS29P62273 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RPS29P62273 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
RPS29P62273 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
RPS29P62273 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.58
RPS29P62273 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RPS29P62273 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS29P62273 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS29P62273 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS29P62273 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS29P62273 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS29P62273 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS29P62273 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS29P62273 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS29P62273 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS29P62273 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS29P62273 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS29P62273 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS29P62273 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS29P62273 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS29P62273 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS29P62273 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS29P62273 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS29P62273 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS29P62273 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS29P62273 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS29P62273 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS29P62273 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS29P62273 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS29P62273 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS29P62273 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS29P62273 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS29P62273 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS29P62273 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS29P62273 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RPS29P62273 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPS29P62273 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPS29P62273 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPS29P62273 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPS29P62273 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPS29P62273 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPS29P62273 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPS29P62273 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPS29P62273 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPS29P62273 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPS29P62273 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPS29P62273 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPS29P62273 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPS29P62273 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPS29P62273 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPS29P62273 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPS29P62273 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPS29P62273 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
RPS29P62273 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPS29P62273 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPS29P62273 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPS29P62273 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPS29P62273 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPS29P62273 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPS29P62273 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPS29P62273 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPS29P62273 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS29P62273 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS29P62273 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS29P62273 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS29P62273 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS29P62273 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS29P62273 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS29P62273 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS29P62273 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS29P62273 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS29P62273 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS29P62273 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS29P62273 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS29P62273 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS29P62273 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS29P62273 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS29P62273 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS29P62273 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS29P62273 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS29P62273 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS29P62273 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS29P62273 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS29P62273 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS29P62273 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS29P62273 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS29P62273 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS29P62273 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS29P62273 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS29P62273 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS29P62273 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS29P62273 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS29P62273 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS29P62273 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS29P62273 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS29P62273 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
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