Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms