Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms