Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
BACE1P56817 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BACE1P56817 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BACE1P56817 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BACE1P56817 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BACE1P56817 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BACE1P56817 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BACE1P56817 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BACE1P56817 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BACE1P56817 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
BACE1P56817 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BACE1P56817 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BACE1P56817 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BACE1P56817 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BACE1P56817 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BACE1P56817 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BACE1P56817 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BACE1P56817 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BACE1P56817 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BACE1P56817 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BACE1P56817 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BACE1P56817 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BACE1P56817 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BACE1P56817 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BACE1P56817 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BACE1P56817 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BACE1P56817 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BACE1P56817 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BACE1P56817 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BACE1P56817 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BACE1P56817 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BACE1P56817 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BACE1P56817 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BACE1P56817 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BACE1P56817 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
BACE1P56817 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BACE1P56817 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BACE1P56817 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BACE1P56817 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BACE1P56817 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BACE1P56817 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BACE1P56817 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BACE1P56817 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BACE1P56817 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BACE1P56817 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BACE1P56817 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BACE1P56817 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BACE1P56817 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BACE1P56817 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BACE1P56817 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BACE1P56817 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BACE1P56817 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BACE1P56817 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BACE1P56817 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BACE1P56817 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BACE1P56817 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BACE1P56817 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BACE1P56817 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BACE1P56817 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BACE1P56817 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BACE1P56817 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BACE1P56817 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BACE1P56817 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BACE1P56817 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BACE1P56817 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BACE1P56817 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BACE1P56817 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BACE1P56817 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BACE1P56817 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BACE1P56817 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BACE1P56817 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BACE1P56817 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BACE1P56817 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BACE1P56817 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BACE1P56817 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BACE1P56817 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BACE1P56817 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BACE1P56817 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BACE1P56817 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BACE1P56817 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BACE1P56817 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BACE1P56817 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BACE1P56817 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
BACE1P56817 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BACE1P56817 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BACE1P56817 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
BACE1P56817 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BACE1P56817 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BACE1P56817 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BACE1P56817 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BACE1P56817 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BACE1P56817 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BACE1P56817 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BACE1P56817 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BACE1P56817 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BACE1P56817 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
BACE1P56817 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BACE1P56817 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BACE1P56817 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BACE1P56817 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms