Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP7P55210 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP7P55210 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP7P55210 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP7P55210 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP7P55210 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP7P55210 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP7P55210 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP7P55210 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP7P55210 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP7P55210 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP7P55210 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP7P55210 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP7P55210 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASP7P55210 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASP7P55210 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASP7P55210 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASP7P55210 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASP7P55210 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASP7P55210 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASP7P55210 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASP7P55210 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASP7P55210 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CASP7P55210 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASP7P55210 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASP7P55210 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASP7P55210 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CASP7P55210 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASP7P55210 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASP7P55210 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASP7P55210 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CASP7P55210 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CASP7P55210 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASP7P55210 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASP7P55210 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASP7P55210 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASP7P55210 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASP7P55210 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASP7P55210 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASP7P55210 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASP7P55210 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CASP7P55210 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASP7P55210 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASP7P55210 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASP7P55210 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASP7P55210 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASP7P55210 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASP7P55210 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASP7P55210 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASP7P55210 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASP7P55210 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASP7P55210 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASP7P55210 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASP7P55210 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASP7P55210 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASP7P55210 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASP7P55210 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASP7P55210 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASP7P55210 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASP7P55210 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASP7P55210 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CASP7P55210 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASP7P55210 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASP7P55210 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASP7P55210 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASP7P55210 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASP7P55210 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASP7P55210 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASP7P55210 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASP7P55210 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASP7P55210 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASP7P55210 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASP7P55210 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASP7P55210 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASP7P55210 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASP7P55210 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASP7P55210 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASP7P55210 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASP7P55210 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASP7P55210 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASP7P55210 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CASP7P55210 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASP7P55210 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASP7P55210 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASP7P55210 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASP7P55210 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASP7P55210 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASP7P55210 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASP7P55210 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASP7P55210 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
CASP7P55210 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASP7P55210 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASP7P55210 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASP7P55210 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASP7P55210 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASP7P55210 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASP7P55210 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASP7P55210 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASP7P55210 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASP7P55210 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms