Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP98P52948 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP98P52948 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP98P52948 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP98P52948 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP98P52948 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP98P52948 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP98P52948 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP98P52948 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP98P52948 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP98P52948 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP98P52948 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP98P52948 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP98P52948 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP98P52948 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP98P52948 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP98P52948 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP98P52948 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP98P52948 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP98P52948 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP98P52948 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP98P52948 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP98P52948 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP98P52948 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP98P52948 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP98P52948 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP98P52948 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP98P52948 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP98P52948 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP98P52948 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP98P52948 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP98P52948 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP98P52948 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP98P52948 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP98P52948 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP98P52948 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP98P52948 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP98P52948 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP98P52948 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP98P52948 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP98P52948 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP98P52948 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP98P52948 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP98P52948 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP98P52948 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP98P52948 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP98P52948 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP98P52948 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP98P52948 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP98P52948 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP98P52948 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP98P52948 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP98P52948 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP98P52948 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP98P52948 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP98P52948 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP98P52948 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP98P52948 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP98P52948 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP98P52948 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP98P52948 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP98P52948 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP98P52948 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP98P52948 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP98P52948 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP98P52948 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP98P52948 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP98P52948 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP98P52948 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP98P52948 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP98P52948 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP98P52948 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP98P52948 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP98P52948 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP98P52948 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP98P52948 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP98P52948 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP98P52948 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP98P52948 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP98P52948 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP98P52948 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP98P52948 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP98P52948 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP98P52948 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP98P52948 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP98P52948 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP98P52948 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP98P52948 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP98P52948 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP98P52948 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP98P52948 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP98P52948 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP98P52948 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP98P52948 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP98P52948 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP98P52948 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP98P52948 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP98P52948 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP98P52948 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP98P52948 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms