Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC36.34■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
SMARCA4P51532 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC36.3■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC36.3■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms