Protein–RNA interactions for Protein: P50416

CPT1A, Carnitine O-palmitoyltransferase 1, liver isoform, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPT1AP50416 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPT1AP50416 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPT1AP50416 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPT1AP50416 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPT1AP50416 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPT1AP50416 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPT1AP50416 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPT1AP50416 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPT1AP50416 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPT1AP50416 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CPT1AP50416 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPT1AP50416 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPT1AP50416 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPT1AP50416 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPT1AP50416 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPT1AP50416 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPT1AP50416 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPT1AP50416 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPT1AP50416 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPT1AP50416 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPT1AP50416 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPT1AP50416 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPT1AP50416 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPT1AP50416 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPT1AP50416 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPT1AP50416 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPT1AP50416 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPT1AP50416 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPT1AP50416 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPT1AP50416 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPT1AP50416 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPT1AP50416 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPT1AP50416 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPT1AP50416 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPT1AP50416 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPT1AP50416 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPT1AP50416 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPT1AP50416 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPT1AP50416 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPT1AP50416 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPT1AP50416 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPT1AP50416 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPT1AP50416 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPT1AP50416 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPT1AP50416 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CPT1AP50416 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CPT1AP50416 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CPT1AP50416 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CPT1AP50416 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CPT1AP50416 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CPT1AP50416 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CPT1AP50416 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CPT1AP50416 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPT1AP50416 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPT1AP50416 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPT1AP50416 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPT1AP50416 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPT1AP50416 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CPT1AP50416 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPT1AP50416 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPT1AP50416 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPT1AP50416 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPT1AP50416 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPT1AP50416 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPT1AP50416 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPT1AP50416 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPT1AP50416 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPT1AP50416 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPT1AP50416 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPT1AP50416 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPT1AP50416 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPT1AP50416 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CPT1AP50416 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPT1AP50416 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPT1AP50416 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPT1AP50416 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPT1AP50416 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPT1AP50416 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPT1AP50416 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPT1AP50416 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPT1AP50416 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPT1AP50416 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPT1AP50416 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPT1AP50416 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPT1AP50416 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CPT1AP50416 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPT1AP50416 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPT1AP50416 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPT1AP50416 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPT1AP50416 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPT1AP50416 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPT1AP50416 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPT1AP50416 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPT1AP50416 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPT1AP50416 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPT1AP50416 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPT1AP50416 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPT1AP50416 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPT1AP50416 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPT1AP50416 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms