Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRE11P49959 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRE11P49959 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRE11P49959 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRE11P49959 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRE11P49959 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRE11P49959 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRE11P49959 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRE11P49959 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRE11P49959 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRE11P49959 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRE11P49959 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRE11P49959 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRE11P49959 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRE11P49959 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRE11P49959 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRE11P49959 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRE11P49959 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRE11P49959 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRE11P49959 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRE11P49959 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRE11P49959 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRE11P49959 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRE11P49959 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRE11P49959 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRE11P49959 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRE11P49959 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRE11P49959 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRE11P49959 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MRE11P49959 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MRE11P49959 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MRE11P49959 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MRE11P49959 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MRE11P49959 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRE11P49959 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRE11P49959 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRE11P49959 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRE11P49959 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRE11P49959 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRE11P49959 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRE11P49959 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRE11P49959 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRE11P49959 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRE11P49959 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRE11P49959 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRE11P49959 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRE11P49959 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRE11P49959 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRE11P49959 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRE11P49959 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRE11P49959 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRE11P49959 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRE11P49959 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRE11P49959 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRE11P49959 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRE11P49959 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRE11P49959 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRE11P49959 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRE11P49959 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MRE11P49959 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRE11P49959 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRE11P49959 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MRE11P49959 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRE11P49959 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MRE11P49959 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRE11P49959 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRE11P49959 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRE11P49959 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MRE11P49959 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRE11P49959 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRE11P49959 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRE11P49959 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRE11P49959 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRE11P49959 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRE11P49959 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRE11P49959 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRE11P49959 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRE11P49959 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRE11P49959 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRE11P49959 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRE11P49959 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRE11P49959 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRE11P49959 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRE11P49959 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRE11P49959 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRE11P49959 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRE11P49959 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRE11P49959 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRE11P49959 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRE11P49959 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRE11P49959 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRE11P49959 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRE11P49959 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRE11P49959 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRE11P49959 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRE11P49959 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRE11P49959 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRE11P49959 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRE11P49959 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRE11P49959 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms