Protein–RNA interactions for Protein: P49760

CLK2, Dual specificity protein kinase CLK2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2P49760 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLK2P49760 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLK2P49760 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLK2P49760 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLK2P49760 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLK2P49760 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLK2P49760 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLK2P49760 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLK2P49760 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLK2P49760 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLK2P49760 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLK2P49760 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLK2P49760 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLK2P49760 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLK2P49760 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CLK2P49760 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLK2P49760 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLK2P49760 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLK2P49760 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLK2P49760 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLK2P49760 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLK2P49760 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLK2P49760 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLK2P49760 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLK2P49760 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLK2P49760 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLK2P49760 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLK2P49760 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLK2P49760 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CLK2P49760 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CLK2P49760 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CLK2P49760 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CLK2P49760 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLK2P49760 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLK2P49760 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLK2P49760 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLK2P49760 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLK2P49760 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLK2P49760 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLK2P49760 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLK2P49760 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLK2P49760 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLK2P49760 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLK2P49760 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLK2P49760 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CLK2P49760 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLK2P49760 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLK2P49760 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLK2P49760 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CLK2P49760 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLK2P49760 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLK2P49760 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLK2P49760 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLK2P49760 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLK2P49760 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLK2P49760 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLK2P49760 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLK2P49760 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLK2P49760 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLK2P49760 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLK2P49760 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLK2P49760 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLK2P49760 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLK2P49760 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLK2P49760 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLK2P49760 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLK2P49760 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLK2P49760 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLK2P49760 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLK2P49760 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLK2P49760 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CLK2P49760 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CLK2P49760 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLK2P49760 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLK2P49760 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CLK2P49760 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLK2P49760 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLK2P49760 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLK2P49760 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLK2P49760 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLK2P49760 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLK2P49760 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLK2P49760 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLK2P49760 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLK2P49760 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLK2P49760 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLK2P49760 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLK2P49760 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLK2P49760 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLK2P49760 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CLK2P49760 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLK2P49760 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLK2P49760 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLK2P49760 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLK2P49760 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLK2P49760 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLK2P49760 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLK2P49760 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLK2P49760 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CLK2P49760 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms