Protein–RNA interactions for Protein: P49711

CTCF, Transcriptional repressor CTCF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCFP49711 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTCFP49711 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTCFP49711 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTCFP49711 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTCFP49711 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTCFP49711 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTCFP49711 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CTCFP49711 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTCFP49711 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTCFP49711 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTCFP49711 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTCFP49711 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTCFP49711 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTCFP49711 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTCFP49711 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTCFP49711 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTCFP49711 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTCFP49711 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTCFP49711 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTCFP49711 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTCFP49711 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTCFP49711 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTCFP49711 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTCFP49711 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTCFP49711 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTCFP49711 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CTCFP49711 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTCFP49711 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTCFP49711 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTCFP49711 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTCFP49711 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTCFP49711 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTCFP49711 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTCFP49711 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTCFP49711 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTCFP49711 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTCFP49711 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTCFP49711 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTCFP49711 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTCFP49711 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTCFP49711 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTCFP49711 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTCFP49711 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTCFP49711 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTCFP49711 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTCFP49711 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTCFP49711 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTCFP49711 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CTCFP49711 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTCFP49711 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTCFP49711 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CTCFP49711 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTCFP49711 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTCFP49711 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTCFP49711 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTCFP49711 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTCFP49711 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTCFP49711 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTCFP49711 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTCFP49711 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTCFP49711 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTCFP49711 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTCFP49711 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTCFP49711 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTCFP49711 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTCFP49711 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTCFP49711 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CTCFP49711 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTCFP49711 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTCFP49711 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTCFP49711 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTCFP49711 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTCFP49711 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTCFP49711 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTCFP49711 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTCFP49711 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTCFP49711 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTCFP49711 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CTCFP49711 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CTCFP49711 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTCFP49711 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTCFP49711 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTCFP49711 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTCFP49711 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTCFP49711 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTCFP49711 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTCFP49711 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTCFP49711 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTCFP49711 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTCFP49711 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTCFP49711 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CTCFP49711 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTCFP49711 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTCFP49711 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTCFP49711 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTCFP49711 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTCFP49711 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTCFP49711 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTCFP49711 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CTCFP49711 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms