Protein–RNA interactions for Protein: P47072

YJL016W, Uncharacterized protein YJL016W, yeastyeast

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YJL016WP47072 RPS27AYKL156W 249 nt0.96□□□□□ -2.26
YJL016WP47072 SDH2YLL041C 801 nt0.96□□□□□ -2.26
YJL016WP47072 NUT2YPR168W 474 nt0.96□□□□□ -2.26
YJL016WP47072 YJR029WYJR029W 5268 nt0.96□□□□□ -2.26
YJL016WP47072 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.96□□□□□ -2.26
YJL016WP47072 RFX1YLR176C 2436 nt0.96□□□□□ -2.26
YJL016WP47072 YDR114CYDR114C 303 nt0.95□□□□□ -2.26
YJL016WP47072 YIL059CYIL059C 366 nt0.95□□□□□ -2.26
YJL016WP47072 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt0.95□□□□□ -2.26
YJL016WP47072 RPL26AYLR344W 384 nt0.95□□□□□ -2.26
YJL016WP47072 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt0.95□□□□□ -2.26
YJL016WP47072 RPL9BYNL067W 576 nt0.95□□□□□ -2.26
YJL016WP47072 SWI4YER111C 3282 nt0.95□□□□□ -2.26
YJL016WP47072 YAP6YDR259C 1152 nt0.94□□□□□ -2.26
YJL016WP47072 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt0.94□□□□□ -2.26
YJL016WP47072 MRPL50YNR022C 420 nt0.94□□□□□ -2.26
YJL016WP47072 STB6YKL072W 2301 nt0.94□□□□□ -2.26
YJL016WP47072 SCC2YDR180W 4482 nt0.94□□□□□ -2.26
YJL016WP47072 EAF1YDR359C 2949 nt0.94□□□□□ -2.26
YJL016WP47072 VPS54YDR027C 2670 nt0.93□□□□□ -2.26
YJL016WP47072 EFR3YMR212C 2349 nt0.93□□□□□ -2.26
YJL016WP47072 ENV11YGR071C 2583 nt0.93□□□□□ -2.26
YJL016WP47072 YHL041WYHL041W 450 nt0.93□□□□□ -2.26
YJL016WP47072 YAR047CYAR047C 321 nt0.93□□□□□ -2.26
YJL016WP47072 PCF11YDR228C 1881 nt0.92□□□□□ -2.26
YJL016WP47072 NOC3YLR002C 1992 nt0.92□□□□□ -2.26
YJL016WP47072 RPS24BYIL069C 408 nt0.92□□□□□ -2.26
YJL016WP47072 YKL083WYKL083W 615 nt0.92□□□□□ -2.26
YJL016WP47072 UPS1YLR193C 528 nt0.92□□□□□ -2.26
YJL016WP47072 BUD3YCL014W 4911 nt0.91□□□□□ -2.26
YJL016WP47072 SCW11YGL028C 1629 nt0.91□□□□□ -2.26
YJL016WP47072 YLR434CYLR434C 384 nt0.91□□□□□ -2.26
YJL016WP47072 ISF1YMR081C 1017 nt0.91□□□□□ -2.26
YJL016WP47072 PRM3YPL192C 402 nt0.91□□□□□ -2.26
YJL016WP47072 BEM2YER155C 6504 nt0.91□□□□□ -2.26
YJL016WP47072 NUT1YGL151W 3399 nt0.91□□□□□ -2.26
YJL016WP47072 SAS3YBL052C 2496 nt0.9□□□□□ -2.27
YJL016WP47072 RPB10YOR210W 213 nt0.9□□□□□ -2.27
YJL016WP47072 KAP120YPL125W 3099 nt0.9□□□□□ -2.27
YJL016WP47072 YLL054CYLL054C 2532 nt0.9□□□□□ -2.27
YJL016WP47072 APL3YBL037W 3078 nt0.89□□□□□ -2.27
YJL016WP47072 SPT21YMR179W 2277 nt0.89□□□□□ -2.27
YJL016WP47072 APL2YKL135C 2181 nt0.89□□□□□ -2.27
YJL016WP47072 AIM9YER080W 1884 nt0.89□□□□□ -2.27
YJL016WP47072 snR72snR72 98 nt0.89□□□□□ -2.27
YJL016WP47072 YJL135WYJL135W 318 nt0.89□□□□□ -2.27
YJL016WP47072 YPL229WYPL229W 621 nt0.89□□□□□ -2.27
YJL016WP47072 SLY1YDR189W 2001 nt0.88□□□□□ -2.27
YJL016WP47072 SLD3YGL113W 2007 nt0.88□□□□□ -2.27
YJL016WP47072 SWF1YDR126W 1011 nt0.88□□□□□ -2.27
YJL016WP47072 MPT5YGL178W 2580 nt0.87□□□□□ -2.27
YJL016WP47072 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt0.87□□□□□ -2.27
YJL016WP47072 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt0.87□□□□□ -2.27
YJL016WP47072 snR51snR51 107 nt0.87□□□□□ -2.27
YJL016WP47072 NPC2YDL046W 522 nt0.86□□□□□ -2.27
YJL016WP47072 YER079WYER079W 633 nt0.86□□□□□ -2.27
YJL016WP47072 YGR042WYGR042W 816 nt0.86□□□□□ -2.27
YJL016WP47072 YKL063CYKL063C 504 nt0.86□□□□□ -2.27
YJL016WP47072 YKL202WYKL202W 582 nt0.86□□□□□ -2.27
YJL016WP47072 YNL324WYNL324W 396 nt0.86□□□□□ -2.27
YJL016WP47072 YPL185WYPL185W 396 nt0.86□□□□□ -2.27
YJL016WP47072 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.86□□□□□ -2.27
YJL016WP47072 ZIP2YGL249W 2115 nt0.86□□□□□ -2.27
YJL016WP47072 PAC1YOR269W 1485 nt0.86□□□□□ -2.27
YJL016WP47072 FIG4YNL325C 2640 nt0.85□□□□□ -2.27
YJL016WP47072 SMC1YFL008W 3678 nt0.85□□□□□ -2.27
YJL016WP47072 IFH1YLR223C 3258 nt0.85□□□□□ -2.27
YJL016WP47072 AGA2YGL032C 264 nt0.85□□□□□ -2.27
YJL016WP47072 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt0.85□□□□□ -2.27
YJL016WP47072 RRT1YBL048W 312 nt0.85□□□□□ -2.27
YJL016WP47072 IRC23YOR044W 474 nt0.85□□□□□ -2.27
YJL016WP47072 SET3YKR029C 2256 nt0.84□□□□□ -2.27
YJL016WP47072 NUP145YGL092W 3954 nt0.84□□□□□ -2.27
YJL016WP47072 YOR199WYOR199W 330 nt0.84□□□□□ -2.27
YJL016WP47072 YBR285WYBR285W 435 nt0.84□□□□□ -2.27
YJL016WP47072 LCD1YDR499W 2244 nt0.84□□□□□ -2.28
YJL016WP47072 PRP16YKR086W 3216 nt0.83□□□□□ -2.28
YJL016WP47072 YJR003CYJR003C 1560 nt0.83□□□□□ -2.28
YJL016WP47072 UBP3YER151C 2739 nt0.83□□□□□ -2.28
YJL016WP47072 STO1YMR125W 2586 nt0.83□□□□□ -2.28
YJL016WP47072 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt0.83□□□□□ -2.28
YJL016WP47072 COG4YPR105C 2586 nt0.82□□□□□ -2.28
YJL016WP47072 YER137W-AYER137W-A 306 nt0.82□□□□□ -2.28
YJL016WP47072 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.82□□□□□ -2.28
YJL016WP47072 SLI15YBR156C 2097 nt0.82□□□□□ -2.28
YJL016WP47072 YDL073WYDL073W 2955 nt0.81□□□□□ -2.28
YJL016WP47072 YNL058CYNL058C 951 nt0.81□□□□□ -2.28
YJL016WP47072 YOL160WYOL160W 342 nt0.81□□□□□ -2.28
YJL016WP47072 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt0.81□□□□□ -2.28
YJL016WP47072 LEE1YPL054W 906 nt0.81□□□□□ -2.28
YJL016WP47072 AIM44YPL158C 2277 nt0.81□□□□□ -2.28
YJL016WP47072 YAR009CYAR009C 3591 nt0.81□□□□□ -2.28
YJL016WP47072 VAR1Q0140 1197 nt0.8□□□□□ -2.28
YJL016WP47072 RPS20YHL015W 366 nt0.8□□□□□ -2.28
YJL016WP47072 YHR138CYHR138C 345 nt0.8□□□□□ -2.28
YJL016WP47072 YBR012CYBR012C 420 nt0.8□□□□□ -2.28
YJL016WP47072 DOP1YDR141C 5097 nt0.79□□□□□ -2.28
YJL016WP47072 INP2YMR163C 2118 nt0.79□□□□□ -2.28
YJL016WP47072 GEA2YEL022W 4380 nt0.79□□□□□ -2.28
YJL016WP47072 NUP157YER105C 4176 nt0.78□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 54.3 ms