Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms