Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPD2P43304 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPD2P43304 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPD2P43304 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPD2P43304 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPD2P43304 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPD2P43304 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPD2P43304 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPD2P43304 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPD2P43304 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPD2P43304 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPD2P43304 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPD2P43304 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPD2P43304 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPD2P43304 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPD2P43304 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPD2P43304 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPD2P43304 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPD2P43304 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPD2P43304 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPD2P43304 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPD2P43304 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPD2P43304 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GPD2P43304 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPD2P43304 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPD2P43304 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPD2P43304 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPD2P43304 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPD2P43304 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPD2P43304 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPD2P43304 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPD2P43304 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
GPD2P43304 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPD2P43304 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPD2P43304 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPD2P43304 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPD2P43304 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPD2P43304 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPD2P43304 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPD2P43304 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPD2P43304 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPD2P43304 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPD2P43304 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPD2P43304 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPD2P43304 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPD2P43304 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPD2P43304 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPD2P43304 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPD2P43304 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GPD2P43304 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPD2P43304 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPD2P43304 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPD2P43304 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPD2P43304 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPD2P43304 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPD2P43304 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPD2P43304 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GPD2P43304 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPD2P43304 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPD2P43304 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPD2P43304 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPD2P43304 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPD2P43304 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPD2P43304 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPD2P43304 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPD2P43304 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPD2P43304 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPD2P43304 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPD2P43304 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPD2P43304 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPD2P43304 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPD2P43304 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPD2P43304 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPD2P43304 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPD2P43304 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPD2P43304 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GPD2P43304 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPD2P43304 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPD2P43304 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPD2P43304 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPD2P43304 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPD2P43304 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPD2P43304 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPD2P43304 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPD2P43304 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPD2P43304 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GPD2P43304 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPD2P43304 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPD2P43304 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPD2P43304 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPD2P43304 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPD2P43304 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPD2P43304 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPD2P43304 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPD2P43304 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPD2P43304 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPD2P43304 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPD2P43304 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPD2P43304 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPD2P43304 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms