Protein–RNA interactions for Protein: P42695

NCAPD3, Condensin-2 complex subunit D3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD3P42695 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC35.93■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC35.91■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
NCAPD3P42695 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
NCAPD3P42695 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
NCAPD3P42695 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
NCAPD3P42695 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
NCAPD3P42695 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
NCAPD3P42695 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
NCAPD3P42695 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
NCAPD3P42695 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
NCAPD3P42695 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
NCAPD3P42695 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
NCAPD3P42695 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
NCAPD3P42695 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
NCAPD3P42695 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
NCAPD3P42695 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
NCAPD3P42695 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
NCAPD3P42695 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
NCAPD3P42695 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
NCAPD3P42695 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
NCAPD3P42695 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
NCAPD3P42695 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
NCAPD3P42695 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
NCAPD3P42695 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
NCAPD3P42695 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
NCAPD3P42695 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
NCAPD3P42695 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
NCAPD3P42695 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
NCAPD3P42695 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
NCAPD3P42695 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
NCAPD3P42695 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
NCAPD3P42695 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
NCAPD3P42695 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms