Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMPOP42166 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMPOP42166 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMPOP42166 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMPOP42166 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMPOP42166 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMPOP42166 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMPOP42166 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMPOP42166 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMPOP42166 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMPOP42166 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMPOP42166 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TMPOP42166 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TMPOP42166 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMPOP42166 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMPOP42166 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMPOP42166 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMPOP42166 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMPOP42166 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TMPOP42166 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMPOP42166 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMPOP42166 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMPOP42166 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMPOP42166 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMPOP42166 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMPOP42166 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMPOP42166 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMPOP42166 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TMPOP42166 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TMPOP42166 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMPOP42166 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMPOP42166 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMPOP42166 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TMPOP42166 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMPOP42166 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMPOP42166 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMPOP42166 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMPOP42166 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMPOP42166 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMPOP42166 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMPOP42166 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMPOP42166 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMPOP42166 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMPOP42166 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMPOP42166 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMPOP42166 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMPOP42166 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMPOP42166 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMPOP42166 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMPOP42166 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMPOP42166 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMPOP42166 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMPOP42166 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMPOP42166 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMPOP42166 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMPOP42166 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMPOP42166 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMPOP42166 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMPOP42166 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMPOP42166 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMPOP42166 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMPOP42166 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMPOP42166 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMPOP42166 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMPOP42166 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMPOP42166 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMPOP42166 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMPOP42166 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMPOP42166 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMPOP42166 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMPOP42166 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMPOP42166 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TMPOP42166 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TMPOP42166 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TMPOP42166 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMPOP42166 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMPOP42166 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMPOP42166 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMPOP42166 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMPOP42166 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMPOP42166 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMPOP42166 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMPOP42166 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMPOP42166 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMPOP42166 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMPOP42166 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TMPOP42166 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMPOP42166 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMPOP42166 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMPOP42166 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMPOP42166 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMPOP42166 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMPOP42166 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMPOP42166 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMPOP42166 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMPOP42166 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMPOP42166 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMPOP42166 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMPOP42166 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TMPOP42166 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms