Protein–RNA interactions for Protein: P40198

CEACAM3, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM3P40198 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms