Protein–RNA interactions for Protein: P40058

YER085C, Uncharacterized protein YER085C, yeastyeast

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YER085CP40058 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt0.58□□□□□ -2.32
YER085CP40058 GPG1YGL121C 381 nt0.57□□□□□ -2.32
YER085CP40058 YGR042WYGR042W 816 nt0.57□□□□□ -2.32
YER085CP40058 ECM12YHR021W-A 456 nt0.57□□□□□ -2.32
YER085CP40058 RPL38YLR325C 237 nt0.57□□□□□ -2.32
YER085CP40058 YLL007CYLL007C 1998 nt0.57□□□□□ -2.32
YER085CP40058 IML1YJR138W 4755 nt0.57□□□□□ -2.32
YER085CP40058 HMLALPHA2YCL067C 633 nt0.56□□□□□ -2.32
YER085CP40058 MATALPHA2YCR039C 633 nt0.56□□□□□ -2.32
YER085CP40058 PRE4YFR050C 801 nt0.56□□□□□ -2.32
YER085CP40058 RPL9AYGL147C 576 nt0.56□□□□□ -2.32
YER085CP40058 RPS27AYKL156W 249 nt0.56□□□□□ -2.32
YER085CP40058 UTP10YJL109C 5310 nt0.55□□□□□ -2.32
YER085CP40058 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.55□□□□□ -2.32
YER085CP40058 YOR282WYOR282W 321 nt0.55□□□□□ -2.32
YER085CP40058 YPL182CYPL182C 384 nt0.55□□□□□ -2.32
YER085CP40058 TSC3YBR058C-A 243 nt0.55□□□□□ -2.32
YER085CP40058 LOA1YPR139C 903 nt0.54□□□□□ -2.32
YER085CP40058 YML002WYML002W 2214 nt0.54□□□□□ -2.32
YER085CP40058 GEA2YEL022W 4380 nt0.53□□□□□ -2.32
YER085CP40058 YHL042WYHL042W 453 nt0.53□□□□□ -2.32
YER085CP40058 URM1YIL008W 300 nt0.53□□□□□ -2.32
YER085CP40058 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt0.53□□□□□ -2.32
YER085CP40058 SNU56YDR240C 1479 nt0.53□□□□□ -2.33
YER085CP40058 YDR029WYDR029W 315 nt0.52□□□□□ -2.33
YER085CP40058 UBX4YMR067C 1251 nt0.52□□□□□ -2.33
YER085CP40058 PAC1YOR269W 1485 nt0.52□□□□□ -2.33
YER085CP40058 NHP2YDL208W 471 nt0.51□□□□□ -2.33
YER085CP40058 PAM16YJL104W 450 nt0.51□□□□□ -2.33
YER085CP40058 YJL135WYJL135W 318 nt0.51□□□□□ -2.33
YER085CP40058 YKL202WYKL202W 582 nt0.51□□□□□ -2.33
YER085CP40058 BFR2YDR299W 1605 nt0.5□□□□□ -2.33
YER085CP40058 PKH2YOL100W 3246 nt0.5□□□□□ -2.33
YER085CP40058 CMC4YMR194C-B 222 nt0.49□□□□□ -2.33
YER085CP40058 PMP1YCR024C-A 123 nt0.48□□□□□ -2.33
YER085CP40058 YFL012WYFL012W 447 nt0.48□□□□□ -2.33
YER085CP40058 RPB10YOR210W 213 nt0.48□□□□□ -2.33
YER085CP40058 LTE1YAL024C 4308 nt0.47□□□□□ -2.33
YER085CP40058 YDR521WYDR521W 336 nt0.47□□□□□ -2.33
YER085CP40058 BIG1YHR101C 1008 nt0.47□□□□□ -2.33
YER085CP40058 YPL261CYPL261C 309 nt0.46□□□□□ -2.34
YER085CP40058 UBP3YER151C 2739 nt0.46□□□□□ -2.34
YER085CP40058 TIM13YGR181W 318 nt0.45□□□□□ -2.34
YER085CP40058 RPL26AYLR344W 384 nt0.45□□□□□ -2.34
YER085CP40058 YNL319WYNL319W 441 nt0.45□□□□□ -2.34
YER085CP40058 YOL160WYOL160W 342 nt0.45□□□□□ -2.34
YER085CP40058 NPR2YEL062W 1848 nt0.45□□□□□ -2.34
YER085CP40058 NOP9YJL010C 2001 nt0.45□□□□□ -2.34
YER085CP40058 CHS6YJL099W 2241 nt0.45□□□□□ -2.34
YER085CP40058 YCR001WYCR001W 315 nt0.44□□□□□ -2.34
YER085CP40058 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.44□□□□□ -2.34
YER085CP40058 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt0.43□□□□□ -2.34
YER085CP40058 snR78snR78 87 nt0.42□□□□□ -2.34
YER085CP40058 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.42□□□□□ -2.34
YER085CP40058 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.42□□□□□ -2.34
YER085CP40058 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.42□□□□□ -2.34
YER085CP40058 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.42□□□□□ -2.34
YER085CP40058 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.42□□□□□ -2.34
YER085CP40058 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.42□□□□□ -2.34
YER085CP40058 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.42□□□□□ -2.34
YER085CP40058 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.42□□□□□ -2.34
YER085CP40058 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.42□□□□□ -2.34
YER085CP40058 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.42□□□□□ -2.34
YER085CP40058 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.42□□□□□ -2.34
YER085CP40058 YIR044CYIR044C 186 nt0.42□□□□□ -2.34
YER085CP40058 YOR218CYOR218C 420 nt0.42□□□□□ -2.34
YER085CP40058 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt0.42□□□□□ -2.34
YER085CP40058 RAD34YDR314C 2079 nt0.41□□□□□ -2.34
YER085CP40058 CDC33YOL139C 642 nt0.41□□□□□ -2.34
YER085CP40058 CUL3YGR003W 2235 nt0.4□□□□□ -2.35
YER085CP40058 YDR344CYDR344C 444 nt0.4□□□□□ -2.35
YER085CP40058 GPI15YNL038W 690 nt0.4□□□□□ -2.35
YER085CP40058 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.39□□□□□ -2.35
YER085CP40058 YKL123WYKL123W 381 nt0.39□□□□□ -2.35
YER085CP40058 YPL044CYPL044C 549 nt0.39□□□□□ -2.35
YER085CP40058 snR72snR72 98 nt0.38□□□□□ -2.35
YER085CP40058 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.38□□□□□ -2.35
YER085CP40058 YLR269CYLR269C 351 nt0.38□□□□□ -2.35
YER085CP40058 UBC7YMR022W 498 nt0.38□□□□□ -2.35
YER085CP40058 YCK3YER123W 1575 nt0.37□□□□□ -2.35
YER085CP40058 NFU1YKL040C 771 nt0.37□□□□□ -2.35
YER085CP40058 INA22YIR024C 651 nt0.36□□□□□ -2.35
YER085CP40058 YSP1YHR155W 3687 nt0.35□□□□□ -2.35
YER085CP40058 RPL26BYGR034W 384 nt0.35□□□□□ -2.35
YER085CP40058 RPS24BYIL069C 408 nt0.35□□□□□ -2.35
YER085CP40058 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.35□□□□□ -2.35
YER085CP40058 BSC3YLR465C 309 nt0.35□□□□□ -2.35
YER085CP40058 PBI2YNL015W 228 nt0.35□□□□□ -2.35
YER085CP40058 snR51snR51 107 nt0.35□□□□□ -2.35
YER085CP40058 YPL185WYPL185W 396 nt0.34□□□□□ -2.36
YER085CP40058 YDL011CYDL011C 324 nt0.33□□□□□ -2.36
YER085CP40058 RPF1YHR088W 888 nt0.33□□□□□ -2.36
YER085CP40058 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt0.33□□□□□ -2.36
YER085CP40058 EAF6YJR082C 342 nt0.33□□□□□ -2.36
YER085CP40058 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.33□□□□□ -2.36
YER085CP40058 FMP27YLR454W 7887 nt0.32□□□□□ -2.36
YER085CP40058 WIP1YDR374W-A 270 nt0.32□□□□□ -2.36
YER085CP40058 SDH7YDR511W 402 nt0.32□□□□□ -2.36
YER085CP40058 YBL071CYBL071C 309 nt0.32□□□□□ -2.36
YER085CP40058 OST1YJL002C 1431 nt0.31□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 36.1 ms