Protein–RNA interactions for Protein: P38192

RRT1, Regulator of rDNA transcription protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRT1P38192 GEA2YEL022W 4380 nt0.42□□□□□ -2.34
RRT1P38192 YLL007CYLL007C 1998 nt0.41□□□□□ -2.34
RRT1P38192 ISD11YER048W-A 285 nt0.41□□□□□ -2.34
RRT1P38192 PRP21YJL203W 843 nt0.41□□□□□ -2.34
RRT1P38192 RPL32YBL092W 393 nt0.41□□□□□ -2.34
RRT1P38192 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt0.4□□□□□ -2.35
RRT1P38192 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt0.4□□□□□ -2.35
RRT1P38192 PAC1YOR269W 1485 nt0.4□□□□□ -2.35
RRT1P38192 VMA21YGR105W 234 nt0.39□□□□□ -2.35
RRT1P38192 YNL050CYNL050C 813 nt0.39□□□□□ -2.35
RRT1P38192 RCN2YOR220W 798 nt0.39□□□□□ -2.35
RRT1P38192 YJR003CYJR003C 1560 nt0.38□□□□□ -2.35
RRT1P38192 YDR269CYDR269C 324 nt0.38□□□□□ -2.35
RRT1P38192 STF2YGR008C 255 nt0.38□□□□□ -2.35
RRT1P38192 APQ13YJL075C 417 nt0.38□□□□□ -2.35
RRT1P38192 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt0.38□□□□□ -2.35
RRT1P38192 RPS30BYOR182C 192 nt0.38□□□□□ -2.35
RRT1P38192 BFR2YDR299W 1605 nt0.38□□□□□ -2.35
RRT1P38192 LTE1YAL024C 4308 nt0.37□□□□□ -2.35
RRT1P38192 ZIP2YGL249W 2115 nt0.37□□□□□ -2.35
RRT1P38192 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt0.36□□□□□ -2.35
RRT1P38192 GPG1YGL121C 381 nt0.36□□□□□ -2.35
RRT1P38192 RPL9AYGL147C 576 nt0.36□□□□□ -2.35
RRT1P38192 YGL239CYGL239C 315 nt0.36□□□□□ -2.35
RRT1P38192 YKL044WYKL044W 321 nt0.36□□□□□ -2.35
RRT1P38192 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt0.36□□□□□ -2.35
RRT1P38192 YOR282WYOR282W 321 nt0.36□□□□□ -2.35
RRT1P38192 PRP16YKR086W 3216 nt0.36□□□□□ -2.35
RRT1P38192 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt0.35□□□□□ -2.35
RRT1P38192 PAN2YGL094C 3348 nt0.35□□□□□ -2.35
RRT1P38192 YER135CYER135C 393 nt0.34□□□□□ -2.36
RRT1P38192 PHS1YJL097W 654 nt0.34□□□□□ -2.36
RRT1P38192 HUG1YML058W-A 207 nt0.34□□□□□ -2.36
RRT1P38192 YOR218CYOR218C 420 nt0.34□□□□□ -2.36
RRT1P38192 EFR3YMR212C 2349 nt0.33□□□□□ -2.36
RRT1P38192 HUR1YGL168W 333 nt0.33□□□□□ -2.36
RRT1P38192 BER1YLR412W 825 nt0.33□□□□□ -2.36
RRT1P38192 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.33□□□□□ -2.36
RRT1P38192 LOA1YPR139C 903 nt0.33□□□□□ -2.36
RRT1P38192 SVS1YPL163C 783 nt0.32□□□□□ -2.36
RRT1P38192 CHS6YJL099W 2241 nt0.32□□□□□ -2.36
RRT1P38192 NPR2YEL062W 1848 nt0.31□□□□□ -2.36
RRT1P38192 Q0255Q0255 1419 nt0.31□□□□□ -2.36
RRT1P38192 PMP1YCR024C-A 123 nt0.31□□□□□ -2.36
RRT1P38192 YGR025WYGR025W 303 nt0.31□□□□□ -2.36
RRT1P38192 YHL042WYHL042W 453 nt0.31□□□□□ -2.36
RRT1P38192 snR13snR13 124 nt0.31□□□□□ -2.36
RRT1P38192 PKH2YOL100W 3246 nt0.31□□□□□ -2.36
RRT1P38192 YJL135WYJL135W 318 nt0.3□□□□□ -2.36
RRT1P38192 RPS27AYKL156W 249 nt0.3□□□□□ -2.36
RRT1P38192 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.3□□□□□ -2.36
RRT1P38192 UTP20YBL004W 7482 nt0.3□□□□□ -2.36
RRT1P38192 YDR029WYDR029W 315 nt0.29□□□□□ -2.36
RRT1P38192 YDR344CYDR344C 444 nt0.29□□□□□ -2.36
RRT1P38192 YJR141WYJR141W 1044 nt0.29□□□□□ -2.36
RRT1P38192 NOP9YJL010C 2001 nt0.29□□□□□ -2.36
RRT1P38192 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.28□□□□□ -2.36
RRT1P38192 RPB10YOR210W 213 nt0.28□□□□□ -2.36
RRT1P38192 TSC3YBR058C-A 243 nt0.28□□□□□ -2.36
RRT1P38192 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt0.27□□□□□ -2.37
RRT1P38192 RPS24BYIL069C 408 nt0.27□□□□□ -2.37
RRT1P38192 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt0.27□□□□□ -2.37
RRT1P38192 CDC33YOL139C 642 nt0.27□□□□□ -2.37
RRT1P38192 ULP2YIL031W 3105 nt0.27□□□□□ -2.37
RRT1P38192 YDL016CYDL016C 303 nt0.26□□□□□ -2.37
RRT1P38192 RPL26BYGR034W 384 nt0.26□□□□□ -2.37
RRT1P38192 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.26□□□□□ -2.37
RRT1P38192 SNU56YDR240C 1479 nt0.25□□□□□ -2.37
RRT1P38192 HMLALPHA2YCL067C 633 nt0.25□□□□□ -2.37
RRT1P38192 MATALPHA2YCR039C 633 nt0.25□□□□□ -2.37
RRT1P38192 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.25□□□□□ -2.37
RRT1P38192 RPL26AYLR344W 384 nt0.25□□□□□ -2.37
RRT1P38192 YPL182CYPL182C 384 nt0.25□□□□□ -2.37
RRT1P38192 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.24□□□□□ -2.37
RRT1P38192 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.24□□□□□ -2.37
RRT1P38192 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.24□□□□□ -2.37
RRT1P38192 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.24□□□□□ -2.37
RRT1P38192 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.24□□□□□ -2.37
RRT1P38192 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.24□□□□□ -2.37
RRT1P38192 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.24□□□□□ -2.37
RRT1P38192 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.24□□□□□ -2.37
RRT1P38192 YKL202WYKL202W 582 nt0.24□□□□□ -2.37
RRT1P38192 UBX4YMR067C 1251 nt0.24□□□□□ -2.37
RRT1P38192 YOL160WYOL160W 342 nt0.24□□□□□ -2.37
RRT1P38192 FMP27YLR454W 7887 nt0.24□□□□□ -2.37
RRT1P38192 SBH1YER087C-B 249 nt0.23□□□□□ -2.37
RRT1P38192 UBC7YMR022W 498 nt0.23□□□□□ -2.37
RRT1P38192 ABF2YMR072W 552 nt0.23□□□□□ -2.37
RRT1P38192 YPL044CYPL044C 549 nt0.23□□□□□ -2.37
RRT1P38192 YCK3YER123W 1575 nt0.23□□□□□ -2.37
RRT1P38192 YSP1YHR155W 3687 nt0.22□□□□□ -2.37
RRT1P38192 snR72snR72 98 nt0.22□□□□□ -2.37
RRT1P38192 BIG1YHR101C 1008 nt0.22□□□□□ -2.37
RRT1P38192 BSC3YLR465C 309 nt0.22□□□□□ -2.37
RRT1P38192 YPL261CYPL261C 309 nt0.22□□□□□ -2.37
RRT1P38192 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt0.22□□□□□ -2.37
RRT1P38192 RAD34YDR314C 2079 nt0.22□□□□□ -2.38
RRT1P38192 TIM13YGR181W 318 nt0.21□□□□□ -2.38
RRT1P38192 CUL3YGR003W 2235 nt0.19□□□□□ -2.38
RRT1P38192 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.19□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 46.3 ms