Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
LTBRP36941 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
LTBRP36941 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LTBRP36941 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
LTBRP36941 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LTBRP36941 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LTBRP36941 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LTBRP36941 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTBRP36941 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTBRP36941 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTBRP36941 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTBRP36941 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
LTBRP36941 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTBRP36941 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTBRP36941 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTBRP36941 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTBRP36941 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
LTBRP36941 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTBRP36941 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTBRP36941 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTBRP36941 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTBRP36941 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTBRP36941 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
LTBRP36941 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTBRP36941 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTBRP36941 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTBRP36941 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTBRP36941 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTBRP36941 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTBRP36941 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTBRP36941 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTBRP36941 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTBRP36941 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTBRP36941 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
LTBRP36941 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTBRP36941 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTBRP36941 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
LTBRP36941 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTBRP36941 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
LTBRP36941 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
LTBRP36941 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTBRP36941 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTBRP36941 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTBRP36941 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTBRP36941 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTBRP36941 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LTBRP36941 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LTBRP36941 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
LTBRP36941 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LTBRP36941 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LTBRP36941 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LTBRP36941 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LTBRP36941 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
LTBRP36941 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LTBRP36941 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
LTBRP36941 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LTBRP36941 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LTBRP36941 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LTBRP36941 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LTBRP36941 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LTBRP36941 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LTBRP36941 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LTBRP36941 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LTBRP36941 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LTBRP36941 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LTBRP36941 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
LTBRP36941 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LTBRP36941 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LTBRP36941 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LTBRP36941 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LTBRP36941 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LTBRP36941 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LTBRP36941 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LTBRP36941 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LTBRP36941 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LTBRP36941 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LTBRP36941 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LTBRP36941 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LTBRP36941 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LTBRP36941 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LTBRP36941 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LTBRP36941 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LTBRP36941 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LTBRP36941 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LTBRP36941 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LTBRP36941 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LTBRP36941 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LTBRP36941 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LTBRP36941 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LTBRP36941 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LTBRP36941 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LTBRP36941 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LTBRP36941 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LTBRP36941 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LTBRP36941 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LTBRP36941 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
LTBRP36941 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
LTBRP36941 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
LTBRP36941 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LTBRP36941 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms