Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTN2P35609 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ACTN2P35609 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ACTN2P35609 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.33■■□□□ 1
ACTN2P35609 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ACTN2P35609 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTN2P35609 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTN2P35609 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTN2P35609 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTN2P35609 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACTN2P35609 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTN2P35609 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ACTN2P35609 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ACTN2P35609 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTN2P35609 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ACTN2P35609 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTN2P35609 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTN2P35609 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTN2P35609 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms