Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPB2P35606 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPB2P35606 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPB2P35606 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPB2P35606 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPB2P35606 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPB2P35606 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPB2P35606 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPB2P35606 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPB2P35606 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPB2P35606 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPB2P35606 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
COPB2P35606 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPB2P35606 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPB2P35606 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPB2P35606 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPB2P35606 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
COPB2P35606 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
COPB2P35606 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPB2P35606 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPB2P35606 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPB2P35606 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPB2P35606 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPB2P35606 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPB2P35606 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPB2P35606 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPB2P35606 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPB2P35606 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPB2P35606 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPB2P35606 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPB2P35606 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPB2P35606 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPB2P35606 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPB2P35606 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPB2P35606 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPB2P35606 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
COPB2P35606 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPB2P35606 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPB2P35606 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPB2P35606 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPB2P35606 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPB2P35606 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPB2P35606 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPB2P35606 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPB2P35606 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPB2P35606 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPB2P35606 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
COPB2P35606 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPB2P35606 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPB2P35606 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPB2P35606 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPB2P35606 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPB2P35606 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPB2P35606 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
COPB2P35606 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPB2P35606 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPB2P35606 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPB2P35606 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
COPB2P35606 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPB2P35606 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPB2P35606 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPB2P35606 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPB2P35606 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPB2P35606 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPB2P35606 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPB2P35606 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPB2P35606 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPB2P35606 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPB2P35606 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPB2P35606 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPB2P35606 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPB2P35606 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPB2P35606 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPB2P35606 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPB2P35606 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPB2P35606 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPB2P35606 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
COPB2P35606 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPB2P35606 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPB2P35606 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPB2P35606 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPB2P35606 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPB2P35606 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPB2P35606 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPB2P35606 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPB2P35606 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPB2P35606 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPB2P35606 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPB2P35606 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPB2P35606 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPB2P35606 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPB2P35606 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPB2P35606 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPB2P35606 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPB2P35606 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPB2P35606 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPB2P35606 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPB2P35606 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPB2P35606 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPB2P35606 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms