Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCD1P33897 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms