Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms