Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP1P29466 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP1P29466 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP1P29466 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP1P29466 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP1P29466 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP1P29466 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP1P29466 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP1P29466 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP1P29466 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP1P29466 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP1P29466 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP1P29466 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP1P29466 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP1P29466 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP1P29466 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP1P29466 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP1P29466 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP1P29466 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP1P29466 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP1P29466 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP1P29466 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP1P29466 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP1P29466 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP1P29466 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP1P29466 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP1P29466 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP1P29466 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP1P29466 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP1P29466 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP1P29466 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP1P29466 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP1P29466 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP1P29466 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP1P29466 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP1P29466 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP1P29466 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP1P29466 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP1P29466 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP1P29466 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP1P29466 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP1P29466 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP1P29466 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP1P29466 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP1P29466 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP1P29466 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP1P29466 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP1P29466 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP1P29466 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP1P29466 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP1P29466 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP1P29466 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP1P29466 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP1P29466 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP1P29466 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP1P29466 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP1P29466 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP1P29466 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP1P29466 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP1P29466 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP1P29466 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP1P29466 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP1P29466 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP1P29466 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP1P29466 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP1P29466 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP1P29466 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP1P29466 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP1P29466 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP1P29466 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP1P29466 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP1P29466 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP1P29466 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP1P29466 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP1P29466 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP1P29466 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP1P29466 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP1P29466 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP1P29466 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP1P29466 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP1P29466 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP1P29466 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP1P29466 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP1P29466 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP1P29466 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP1P29466 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP1P29466 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP1P29466 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP1P29466 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP1P29466 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP1P29466 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP1P29466 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP1P29466 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP1P29466 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP1P29466 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP1P29466 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP1P29466 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP1P29466 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP1P29466 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP1P29466 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms