Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
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PTPRMP28827 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PTPRMP28827 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PTPRMP28827 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PTPRMP28827 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PTPRMP28827 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRMP28827 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRMP28827 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRMP28827 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
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