Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms