Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PLNP26678 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PLNP26678 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PLNP26678 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PLNP26678 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PLNP26678 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PLNP26678 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PLNP26678 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PLNP26678 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PLNP26678 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PLNP26678 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PLNP26678 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PLNP26678 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PLNP26678 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PLNP26678 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PLNP26678 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PLNP26678 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PLNP26678 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PLNP26678 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PLNP26678 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PLNP26678 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PLNP26678 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PLNP26678 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PLNP26678 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PLNP26678 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PLNP26678 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PLNP26678 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PLNP26678 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PLNP26678 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PLNP26678 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PLNP26678 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PLNP26678 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PLNP26678 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PLNP26678 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PLNP26678 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PLNP26678 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PLNP26678 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PLNP26678 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PLNP26678 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PLNP26678 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PLNP26678 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PLNP26678 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PLNP26678 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PLNP26678 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PLNP26678 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PLNP26678 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PLNP26678 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PLNP26678 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PLNP26678 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PLNP26678 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PLNP26678 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PLNP26678 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PLNP26678 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PLNP26678 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PLNP26678 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PLNP26678 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PLNP26678 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PLNP26678 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PLNP26678 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PLNP26678 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PLNP26678 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PLNP26678 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PLNP26678 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PLNP26678 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PLNP26678 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PLNP26678 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PLNP26678 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PLNP26678 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PLNP26678 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PLNP26678 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PLNP26678 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PLNP26678 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PLNP26678 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PLNP26678 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PLNP26678 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PLNP26678 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PLNP26678 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PLNP26678 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PLNP26678 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PLNP26678 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PLNP26678 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PLNP26678 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PLNP26678 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PLNP26678 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PLNP26678 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PLNP26678 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PLNP26678 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PLNP26678 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PLNP26678 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PLNP26678 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PLNP26678 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PLNP26678 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLNP26678 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLNP26678 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLNP26678 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLNP26678 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLNP26678 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLNP26678 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLNP26678 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLNP26678 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms