Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms