Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR2AP24928 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR2AP24928 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms