Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP2B4P23634 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms